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El tomate es originario de América y su nombre deriva de la expresión tómatl, de la lengua Nahuatl utilizada por los indígenas aztecas y que los colonizadores castellanos tradujeron por tomate. Actualmente, se conocen 13 especies de tomate pertenecientes al género Solanum, 12 de éstas, silvestres y una cultivada, todas ellas diploides con igual número de cromosomas (2n=2x=24).El tomate cultivado (Solanum lycopersicum L.) es una especie autógama y de reducida base genética, mientras que las especies silvestres representan una importante fuente de variabilidad y constituyen recursos genéticos de gran valor. El tomate es una Solanácea de gran importancia económica en el mundo y, en Argentina, es una de las hortalizas más importantes por el nivel de consumo, el valor económico de la producción y la superficie destinada al cultivo. Si bien es un alimento poco energético, aproximadamente el 95% de su peso es agua y cerca de un 4% son hidratos de carbono, es una fuente importante de ciertas sales minerales (principalmente, potasio y magnesio). Además, de su contenido en vitaminas se destacan la B1, B2, B5, C y carotenoides como el licopeno que tiene propiedades antioxidantes. El objetivo de este trabajo fue caracterizar distintos genotipos cultivados y silvestres mediante marcadores moleculares de ADN del tipo SSR. El material vegetal utilizado consistió en los cultivares Caimanta, Zebra Green y Red Purple de S. lycopersicum, la accesión LA722 de S. pimpinellifolium y tres líneas endocriadas recombinantes (RILs, Recombinant Inbred Lines) ToUNR1, ToUNR17 y ToUNR18, obtenidas del cruzamiento entre el cultivar Caimanta y la accesión LA722. Caimanta tiene un hábito de crecimiento determinado, plantas compactas, frutos de tipo platense (mayor diámetro que altura), con un promedio de peso de 98,5 ± 9,9 g y una vida poscosecha promedio de 9,7 ± 0,9 días. Los cultivares Zebra Green y Red Purple de S. lycopersicum tienen frutos de colores particulares, siendo los primeros tomates con rayas oscuras verdes y amarillas y los segundos de color marrón rojizo. La línea LA722 de S. pimpinellifolium tiene hábito de crecimiento indeterminado y un gran número de flores por inflorescencia, con frutos esféricos y de tamaño pequeño, con 0,9 ± 0,1 g de peso y 18,7 ± 0,4 días de vida poscosecha. Las RILs ToUNR1 y ToUNR18 fueron seleccionadas por presentar combinaciones favorables para caracteres de calidad, mostrando además mayor vida poscosecha que ambos progenitores (ToUNR1: 21,2 ± 0,6 días y ToUNR18: 23,1 ± 0,7 días). Sus respectivos pesos son de 27,2 ± 0,7 g y 18,2 ± 0,5 g y la línea ToUNR18 se caracteriza por tener frutos ovales. Por su parte la línea ToUNR17 exhibe frutos de color amarillo y con 25,2 g de peso y una vida poscosecha de 39,1 días. Para la caracterización molecular del material vegetal descripto se realizó la extracción de ADN genómico a partir de hojas jóvenes de al menos 4 plantas por genotipo siguiendo un protocolo estándar para las 41 muestras analizadas. Se emplearon 25 marcadores moleculares del tipo SSR, también llamados microsatélites, para los que se conoce la secuencia de primers, el tamaño de los alelos del genotipo cultivado y el silvestre y su localización cromosómica. La metodología para los SSR se realizó siguiendo protocolos estándares. En base a la información obtenida de los marcadores de ADN se calcularon los porcentajes de polimorfismo entre los genotipos y se los agrupó mediante un análisis de conglomerados realizado por el método de encadenamiento simple empleando la distancia de Simple Matching para establecer la similitud entre los genotipos. El porcentaje de polimorfismo encontrado entre todos los genotipos fue del 92%, siendo monomórficos solamente dos de los SSR analizados. Entre los cultivares del género S. lycopersicum las diferencias fueron mínimas hallándose un 8% de polimorfismo. Al comparar las RILs con cada uno de sus progenitores se encontraron mayores discrepancias con LA722 que con Caimanta, alcanzando un 88% y un 44% de polimorfismo en relación a cada progenitor respectivamente. Entre RILs el polimorfismo fue de un 40%. Durante el análisis molecular se detectaron alelos exclusivos para determinados marcadores en las líneas ToUNR17 y ToUNR18 y en los cultivares Z. Green y R. Purple, es decir que se encontraron bandas diferentes a las observadas en los demás genotipos. El análisis de conglomerados basado en polimorfismos moleculares mostró tres grupos de genotipos, la especie silvestre, las RILs y los cultivares. Se concluye que a partir de la caracterización molecular por SSR es posible diferenciar cada genotipo. Además, el análisis multivariado permite agrupar los genotipos en función de las distancias y confirma la clasificación taxonómica de estos genotipos.

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