Primeros avances paleogenómicos para la identificación de patógenos antiguos en Patagonia Argentina (6000-300) años AP

1. PAROLIN ML, BRAVO LÓPEZ M, GUZMÁN-SOLÍS A, TAMBURRINI C, VILLA-ISLA, V, FREGEL R, DAHINTEN S, GÓMEZ-OTERO J, MILLÁN G, BUSTAMANTE C, ÁVILA-ARCOS M

Jujuy

Jornada; XIV Jornadas Nacionales de Antropología Biológica; 2019

Asociación de Antropología Biológica Argentina

La aplicación de métodos paleogenómicos al campo del estudio de patógenos antiguos ha permitido no solo la caracterización genómica de los agentes causales de brotes epidémicos históricos, sino también ha generado valiosa información sobre su evolución y patogenicidad. Estas investigaciones se han centrado principalmente en las enfermedades infecciosas de poblaciones europeas históricas y prehistóricas, siendo aún incipiente la caracterización molecular de los patógenos que afectaron a las poblaciones antiguas de Latinoamérica.En este trabajo se presentan los primeros datos de patógenos antiguos obtenidos en restos humanos pre y post-contacto europeo de la Patagonia Argentina (6000-300 años AP). En una primera etapa se logró obtener ADNa de diecinueve individuos que fueron analizados mediante secuenciación de nueva generación (NGS) de mediana cobertura. Se seleccionaron las lecturas obtenidas que no mapearon contra el genoma de referencia de humano para llevar a cabo una asignación taxonómica. Las lecturas genómicas fueron asignadas a bacterias (85%), virus (10%) y arqueas (5%).Con la finalidad de descartar la presencia de ADN de patógenos contemporáneos, se analizaron los patrones de daño. Entre las secuencias antiguas recuperadas, hemos identificado en dos individuos pre-contacto la presencia de Haemophilus influenzae, agente causante de bacteremia y pneumonia. Por otra parte, en dos individuos post-contacto se identificó la presencia de Tannerella forsythia y Actinomyces oris, ambos patógenos asociados con enfermedad peridontal. En una segunda etapa se espera obtener genomas de mayor cobertura para resolver relaciones filogenéticas entre cepas antiguas y modernas e inferir vías evolutivas, así como los mecanismos moleculares implicados en su patogenicidad.