IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION RAPIDA DE LEVADURAS MEDIANTE AMPLIFICACION POR PCR DE REGIONES MICRO/MINI-SATELITES

LIBKIND FRATI, D; RUSSO, G; DE GARCÍA, V; BRIZZIO, S; VAN BROOCK, MR

Bs.As.

Congreso; X Congreso Argentino de Micología y XX Jornadas Argentina de Micología; 2005

La regiones de ADN repetidas denominadas Micro o Minisatelites presentan un alta grado de polimorfismo en levaduras. Esto puede ser aprovechado para la identificación y/o caracterización de especies mediante la amplificación por PCR de ADN genómico empleando primers específicos para estas regiones. En el presente trabajo se evaluó el potencial de la técnica para la identificación de levaduras pigmentadas aisladas de ambientes acuáticos de la Patagonia noroccidental. Se utilizaron individualmente los primers (GTG)5 y (GAC)5 para amplificar regiones microsatelites y el primer M13 para regiones minisatelites en reacciones de PCR. Las levaduras fueron finalmente identificadas mediante secuenciación parcial de la subunidad ribosomal 26S. De un total de 225 cepas analizadas, se detectaron 25 perfiles de ADN diferentes, de los cuales un 72% pudo ser identificado rápidamente (36%) por comparación directa con cepas testigo o al menos agrupado (36%). Las especies identificadas por este método fueron Rhodotorula mucilaginosa, Rh. minuta, Rh. laryngis, Rh. colostrii, Rhodosporidium babjevae, R. kratochvilovae, Cystofilobasidium capitatum, Sporobolomyces ruberrimus y  Sporidiobolus salmonicolor. Se obtuvieron patrones de bandas de ADN especie específicos, permitiendo su correcta y rápida identificación o agrupamiento. Los primers utilizados mostraron diferentes grados de resolución para los distintos grupos taxonómicos estudiados. Esto demuestra su potencial aplicación en la identificación de levaduras no solo de ambientes naturales sino también de interés médico y biotecnológico.