Detección de QTL de interés agronómico mediante marcadores InDel desarrollados en base a enfoques ómicos en tomate (Solanum lycopersicum).

CACCHIARELLI, P.; TAPIA, E.; GUILLERMO RAUL PRATTA

Valdivia (virtual)

Congreso; XVIII Congreso Latinoamericano de Genética (ALAG 2021); 2021

ALAG

Por análisis transcriptómico de la madurez del fruto, se identificó expresión diferencial para 4sHSP del cromosoma 6 entre cv. Caimanta (C, tomate cultivado) y LA0722 (P, S.pimpinellifolium). En base al genoma completo de ambos genotipos, progenitores denumerosas poblaciones de mejoramiento, se desarrollaron marcadores InDel específicos parala región de aproximadamente 17,9 kb en que mapean las sHSP. Estos InDel permitierondiferenciar molecularmente entre C, P y dos líneas recombinantes (RIL1 y RIL18) obtenidasde su cruzamiento. El objetivo fue caracterizar 18 familias F 4 derivadas del híbrido RIL18 xRIL1 con 3 InDel, a fin de detectar QTLs para caracteres de calidad de fruto (peso, diámetro,altura, forma, pH y vida poscosecha) que mostraron variancia genética significativa. Doceplantas de cada familia F 4 se sembraron en invernadero en bloques completamentealeatorizados. Para la detección de QTL, se verificó la distribución normal y se aplicó unANOVA a dos criterios de clasificación, con Familia y Marcador como fuentes de variación.Se encontraron diferencias significativas entre Familias para todos los caracteres, peroMarcador solo fue significativo para peso, altura y pH con los 3 InDel analizados. Lasinteracciones Familia x Marcador fueron no significativas en todos los casos. En base aenfoques ómicos, se detectaron QTL robustos para peso, altura y pH del fruto.Adicionalmente, la identificación de polimorfismos estructurales en la secuencia nucleotídicade una región del cromosoma 6 permitió identificar una relación funcional entre la expresióndiferencial de cuatro sHSP y la variancia genética significativa para caracteres de calidad. (Trabajo Premiado)