INVESTIGADORES
PRATTA Guillermo Raul
congresos y reuniones científicas
Título:
Polimorfismo genómico detectado por NGS y su aplicación en un programa de mejoramiento de tomate (Solanum spp.)
Autor/es:
CAMBIASO, V.; PEREIRA DA COSTA, J.H.; PICARDI, L.A.; PRATTA, G.R.; ZORZOLI, R; RODRIGUEZ, G.R.
Lugar:
Rosario
Reunión:
Simposio; Simposio de Genómica Funcional de Plantas; 2017
Resumen:
Desde la obtención del genoma de referencia en tomate se han secuenciado más de 400 genotipos cultivados y silvestres. El objetivo del trabajo fue utilizar el polimorfismo genómico detectado entre el cultivar Caimanta (C) de Solanum lycopersicum y la entrada LA722 (P) de S. pimpinellifolium para construir un mapa de ligamiento genético en la generación F2 derivada del cruzamiento entre ellos y comparar la distancia genética entre los progenitores del cruzamiento respecto a la existente en el germoplasma del cultivo. Se desarrollaron 132 marcadores a partir de la secuencia de C y P. Con los datos genotipos de la F2, se obtuvo un mapa de ligamiento con una longitud total de 1.495,6 centimorgan (cM), una distancia promedio entre marcadores consecutivos de 10,3 cM y una distancia máxima de 43,8 cM. Se utilizó la información disponible en bases de datos públicas de 35 genotipos de tomate secuenciados para analizar la variabilidad genética. Se caracterizaron genotípicamente C, P y los 35 cultivares seleccionados mediante 229 SNP (polimorfismos de nucleotido simple) distribuidos en regiones no codificantes a lo largo de todo el genoma. El análisis de conglomerados evidenció que C y P representan gran parte de la variabilidad genética del germoplasma de tomate y que los cultivares se agruparon de acuerdo a su tipo (silvestres, criollos, tradicionales o contemporaneos). Se concluye que el polimorfismo detectado entre C y P permitió construir un mapa de ligamiento y determinar que el cruzamiento entre estos genotipos abarca gran parte de la variabilidad genética disponible en tomate.