Comparación entre métodos de análisis multivariado para la caracterización molecular de clones de banana

MERLO, G.; ERMINI, J.L.; TENAGLIA, G.; PRATTA, G.R.

Rosario

Congreso; XVIII Congreso y XXXV Reunión Anual de la Sociedad de Biología de Rosario; 2015

Sociedad de Biología de Rosario

La banana comestible (Musa acuminata) es una especie de reproducción asexual. Por lo tanto, la estimación de los componentes de variación genética por los métodos clásicos, que requieren en general evaluar progenies y progenitores, presenta limitaciones. Como alternativa, la caracterización molecular permite la estimación directa del componente de variación genético dentro de la variación fenotípica, cuyo conocimiento es necesario para diseñar eficientemente estrategias de mejoramiento. Los marcadores de ADN son una aplicación de la biología molecular que permite medir este tipo de variación, siendo el AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) o Polimorfismo en la Longitud de los Fragmentos Amplificados, una técnica de gran utilidad por la gran proporción de cobertura del genoma que logra. Por otro lado, una vez relevado el polimorfismo molecular, es necesario emplear análisis bioestadísticos que extraigan información de las grandes bases de datos generadas, en la calidad y la cantidad requeridas por las necesidades del programa de mejoramiento. El objetivo de este trabajo fue comparar la información extraída por tres métodos de análisis multivariado (conglomerados, coordenadas principales y componentes principales) en la caracterización molecular de una población de clones de banana recolectados en campos de productores de la provincia de Formosa. Se utilizaron 25 clones con registros completos para 533 bandas polimórficas de AFLP. La métrica empleada en los análisis de conglomerados y de coordenadas principales fue la distancia de Jaccard, aplicándose el método UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean, o Método no Ponderado de Agrupamiento de a Pares con la Media Aritmética) para obtener el dendrograma respectivo. A pesar de que el análisis de componentes principales está propuesto para variables cuantitativas, antecedentes del grupo de trabajo demostraron que en tomate es posible obtener resultados robustos calculando las componentes a partir de datos dicotómicos, por lo que también se aplicó a la presencia/ausencia de bandas en la población de banana bajo estudio, utilizando covariancias. El análisis de connglomerados separó a los clones en cuatro grupos: tres incluyeron varios clones con satisfactorio acuerdo al campo de productor en que fueron recolectados, y un grupo incluyó a un único clon, que fue considerado fuera de tipo. La información fue de naturaleza descriptiva. Considerando la posición de los clones en los planos definidos por las dos primeras coordenadas principales y componentes principales, respectivamente, se conservaron las asociaciones entre clones, pero el número de grupos se redujo a tres, ya que se incluyó al clon fuera de tipo dentro del grupo correspondiente al productor en cuyo campo fue recolectado. Además, aunque resultó baja (18% y 21%, respectivamente), estos análisis permitieron medir la proporción de variancia molecular explicada por los vectores obtenidos. Mediante componentes principales fue posible, además, identificar las bandas de AFLP con mayor contribución a la variación molecular. Se concluye que este método es el que brindó información de calidad y cantidad requerida por el programa de mejoramiento genético de banana.