Detección de secuencias correspondientes al gen mama en sedimentos antárticos marinos y lacustres.

CORIA SH; LÓPEZ JL; LIRIO J.M.; VIGNONI P.A.; KOPALOVÁ, K; LECOMTE K.L.; GARGIULO J.D.; CHAPARRO M.A.E.; VÁZQUEZ S; DIONISI HM; LOZADA M; MAC CORMACK W.P.

Congreso; Congreso Argentino de Microbiología Ambiental y Agrícola.; 2015

Las bacterias magnetotácticas (MTB) representan un grupo heterogéneo de organismos gramnegativos, ubicuo, presentes en la zona de transición óxica-anóxica de diversos hábitats acuáticos. Las MTB presentan magnetotaxis, es decir que se orientan con el campo magnético terrestre, gracias a la biosíntesis de cristales de magnetita (Fe3O4) o greigita (Fe3S4) dentro de una estructura de membrana llamada magnetosoma. Asociada a la membrana del magnetosoma se encuentra la proteína MamA: magnetosome associated TPR-containing protein Los TPR (tetratricopeptide repeats) permitirían la interacción proteína-proteína en complejos multiproteicos. Se analizaron 11 muestras de sedimentos de dos regiones de la península antártica: lacustres de Isla Vega y marinos de Caleta Potter. Las muestras de Isla Vega fueron sometidas a un proceso doble de enriquecimiento magnético obteniéndose una biomasa bacteriana a partir de la cual se aisló ADN genómico total que se usó como templado para la detección del gen mamA mediante PCR anidada utilizando dos pares de primers diseñados específicamente para este trabajo, determinando un producto de amplificación de 252 pb. Con la muestra de la laguna Pan Negro se obtuvo un producto del tamaño esperado, cuya secuencia nucleotídica comparte 99% de identidad con el gen mamA de Magnetospirillum magnetotacticum (AY508230).Por otro lado, se realizó la búsqueda de secuencias correspondientes a mamA en seis metagenomas de sedimentos de Caleta Potter obtenidos previamente por autores de este trabajo y públicos en la plataforma IMG/M (http://img.jgi.doe.gov/m/; Gs0063447). Se construyó un árbol filogenético con las secuencias obtenidas de los metagenomas, la secuencia lacustre y las secuencias más relacionadas depositadas a la fecha en bases de datos. Se observó un origen homólogo para todas las secuencias incluidas en el análisis. A su vez, la secuencia obtenida de Pan Negro representa una secuencia cercana a las del género Magnetospirillum mientras que las secuencias de los sedimentos marinos se ubican en un grupo separado junto con las secuencias de otras MTB.El estudio de las MTB es relevante tanto desde un punto de vista académico y biotecnológico. Hasta el presente, y a pesar de considerarse ubicuos, hasta donde sabemos este sería el primer reporte de la presencia de MTB en Antártida a excepción de aquellos estudios que refieren a la presencia de magnetofósiles, los cuales datarían del paleoceno-eoceno.