Análisis de la secuencia del genoma de Bacillus thuringiensis serovar darmstadiensis INTA Mo14-4, una cepa argentina con actividad nematicida

MELISA PÉREZ; DIEGO SAUKA; LEOPOLDO PALMA; AUGUSTO SALAS; BARBARA GHIGLIONE; MARCELO BERRETTA

La Plata

Congreso; V Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental; 2021

Asociación Argentina de Microbiología

Bacillus thuringiensis es una bacteria que produce durante la esporulación uno o más cuerpos parasporales cristalinos de naturaleza proteica responsables de actividad letal para diversos artrópodos y ciertos nematodos. Actúan previa ingestión por parte del huésped, resultando en su intoxicación, daño intestinal y consiguiente muerte. La cepa argentina INTA Mo14-4 perteneciente al serovar darmstadiensis de B. thuringiensis produce un cristal bipiramidal y una inclusión en forma de barra, conteniendo proteínas de 130, 60 y 40 kDa. Además, cultivos esporulados de esta cepa mostraron niveles altos de toxicidad para el nematodo de vida libre Panagrellus redivivus. Es escasa la información acerca de cepas nematicidas de esta especie, siendo más escasa aún aquella asociada a secuencias de sus genomas. El objetivo de este trabajo fue analizar la secuencia del genoma de INTA Mo14-4, focalizando en la identificación de genes asociados con factores de virulencia. La secuenciación Illumina del DNA genómico total se llevó a cabo en el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (Texcoco, México). Para el ensamblado de las lecturas se empleó el software CLC Genomic Workbench 21.0.3, y para la anotación de secuencias codificantes (CDs) el servidor RAST. Además, la integridad del ensamblaje se evaluó con BUSCO utilizando el conjunto de datos del linaje Bacillales de ortólogos conservados de una sola copia. En cuanto a la secuenciación genómica, tras el ensamblaje, se obtuvieron 261 contigs con un tamaño total de 6.403.763 pb y un porcentaje de G+C de 35,1%, representando un 99,8% de completitud del genoma. La anotación permitió delimitar 6.986 CDs de entre las cuales una, mostró un 99% de identidad con la toxina Cry5Ba1. Otras dos CDs mostraron homología con las toxinas Cry21Aa1 y Cry65Aa1. Estas toxinas se han asociado con toxicidad para ciertos nematodos, no obstante, su rol como responsables de la actividad nematicida de INTA Mo14-4 queda pendiente de comprobación.