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El algodón (Gossypium spp.) representa una de las especies de más amplia difusión como fuente de fibra natural y es un cultivo regional clave para la región del Noroeste argentino, siendo la cadena agroindustrial de este cultivo muy importante en el aspecto económico y social de la región. En Argentina existen numerosas enfermedades que afectan al cultivo de algodón, sin embargo, sólo algunas resultan de importancia económica por su prevalencia y por los daños que ocasionan. La enfermedad azul del algodón es la principal enfermedad de origen viral que afecta al cultivo en el país y causa importantes pérdidas económicas si no se emplean medidas adecuadas de control consistentes en la siembra de variedades resistentes y en la aplicación de insecticidas. La enfermedad es producida por el cotton leafroll dwarf virus (CLRDV) y el virus es transmitido en forma circulativa y no propagativa por el pulgón Aphis gossypii no siendo posible su transmisión mecánica. Los síntomas de la enfermedad son enanismo, enrollamiento de las hojas, coloración verde oscura-azulada y nervaduras amarillas. El genoma del CLRDV fue secuenciado por el grupo y se clasificó como una nueva especie dentro del género Polerovirus. En las campañas algodoneras de 2009/10/11 se detectó por primera vez, en la provincia de Chaco, una nueva virosis tanto en variedades de algodón susceptibles como resistentes al CLRDV. El genoma de este virus fue secuenciado y propuesto como una variante atípica del CLRDV denominada cotton leafroll dwarf virus-atypical (CLRDV-at). El CLRDV-at establece una infección más suave con síntomas diferentes a enfermedad azul. Las plantas afectadas por el CLRDV-at tienen reducción en la calidad y cantidad de fibra y en el número de semillas por cápsula. Además, presentan una mala defoliación que durante la cosecha produce que las hojas senescentes sean recolectadas junto con los capullos, afectando la calidad del producto y reduciendo su valor comercial. Desde la campaña del 2010, la nueva enfermedad se dispersó a las principales áreas de cultivo del algodón, transformándose en un serio problema y en un nuevo desafío para el manejo del cultivo, debido a que todas las variedades que se siembran actualmente son susceptibles al CLRDV-at y no se han identificado hasta el momento variedades resistentes o tolerantes a la infección.El CLRDV y el CLRDV-at presentan una alta identidad de secuencia entre la mayoría de sus proteínas (95%-98%), sin embargo, presentan una diferencia del 88% en la secuencia de la proteína P0. En varios polerovirus se demostró que la proteína P0 posee actividad supresora del mecanismo de silenciamiento del RNA, que constituye el principal sistema de defensa de las plantas frente a virus. Ambas proteínas P0 tienen actividad supresora de silenciamiento, aunque la proteína P0 del CLRDV-at presenta una menor actividad supresora que P0 del CLRDV. Para evaluar si la proteína P0 del CLRDV-at estaba involucrada en el cambio de sintomatología y en el quiebre de la resistencia del germoplasma de algodón se realizó el reemplazo de la proteína P0 del CLRDV-at en un clon infectivo del CLRDV, dando lugar a la construcción quimérica 35S/CLRDV-P0CL-at. El virus quimérico CLRDV-P0CL-at logró establecer la infección en variedades de algodón resistentes al CLRDV y los síntomas observados se asemejaron a los producidos por el CLRDV-at. Estos resultados muestran que la proteína P0 del CLRDV-at es el determinante de avirulencia (Avr) involucrado en el quiebre de la resistencia, dada por el gen dominante Cbd, y la responsable del cambio de síntomas. El estudio de los patosistemas algodón-CLRDV y algodón-CLRDV-at permitirá dilucidar las características particulares en el establecimiento de la infección para lograr un mejor control de ambas enfermedades.