Identificación de los primeros marcadores codominantes (SNPs y SSRs) y desarrollo de SSR en regiones polimórficas en Mimosa bifurca Benth. (Fabaceae)

MARTÍNEZ, NAHUEL M.; MORALES, MATÍAS; CALDERÓN, FRANCO; AGUIRRE, NATALIA

Paraná

Congreso; XXXVIII Jornadas Argentinas de Botánica; 2021

Sociedad Argentina de Botánica/Facultad de Ciencias Agrarias - Universidad de Entre Ríos

Mimosa bifurca Benth. es una especie de la sección Batocaulon serie Stipellares y exhibe alta variación morfológica y posible hibridación homoploide, siendo de interés obtener marcadores moleculares para futuros estudios de diversidad y estructura genética. Se planteó el desarrollo de microsatélites (SSRs), evaluación de su polimorfismo y detección de SNPs. Se extrajo ADN de 2 individuos de M. bifurca, que se genotiparon por ddRADseq con 2 secuenciaciones NGS de Illumina Paired End (2x75 y 2x250). El ensamblado de novo de las lecturas y la identificación de SNPs se realizó con Stacks. Los SSRs fueron identificados con el programa MISA. A partir de los SSR polimórficos se diseñaron cebadores mediante Primer3 y se usó BLAST para estudiar la homología con secuencias en GenBank de otras especies. Se obtuvieron 2.485 SSRs y 20.811 SNPs, se identificaron 29 SSRs polimórficos. de los que se pudieron desarrollar 12 pares de cebadores. Una porción de una de las regiones donde se diseñaron primers para un SSR polimórfico presentó homologías con otras especies de Fabaceae: Vigna angularis, V. unguiculata y Prosopis alba. Los resultados obtenidos en M. bifurca son comparables a los de otras especies del clado Mimosoideae (P. alba) y de Mimosa (M. scabrella), donde también se aplicaron técnicas de NGS para la búsqueda de SSRs y SNPs. La metodología usada permitió el desarrollo de SSR en regiones polimórficas e identificar SNPs por primera vez en M. bifurca.