Avances en la detección de Thecaphora frezii en muestras de suelo

DUMÓN, A.D.; MONGUILLOT, J.H.; RAGO, A.M.; BERNARDI LIMA, N.; SERRI; D.; CONFORTO, E.C.; PAREDES, J.A.; VARGAS GIL, S.

Jornada; XXXIV Jornada Nacional del Maní; 2019

IntroducciónEl carbón del maní, cuyo agente causal es Thecaphora frezii, desde su primer reporte hasta la actualidad, se ha convertido en una enfermedad epidémica en los campos de maní de la provincia de Córdoba. Es una enfermedad monocíclica, por lo que su intensidad depende directamente de la cantidad de inóculo inicial en el suelo. La relación entre la densidad de inóculo presente en el suelo al momento de la siembra con la intensidad de la enfermedad y las pérdidas que causa, resulta un aspecto de gran relevancia para evaluar y desarrollar estrategias de manejo. En la actualidad los métodos utilizados para cuantificación de teliosporas son basados en la observación directa por microscopia óptica, lo cual implica excesivo tiempo de ejecución e imprecisión en los resultados, por este motivo resulta imprescindible explorar nuevas metodologías tendientes a eficientizar el proceso de cuantificación de inóculo en el suelo. El objetivo de este trabajo fue ajustar la extracción y técnica de PCR a partir de muestras de suelo provenientes del área núcleo productora para la detección de teliosporas de T. frezii.Materiales y MétodosEn la campaña 2017/2018 se realizó un muestreo obteniendo muestras compuestas de suelo correspondientes a la zona núcleo manisera, las cuales fueron tamizadas y conservadas a -20 °C para su posterior procesamiento. A partir de 0.5 gramos de suelo de 4 muestras se realizó la extracción de DNA utilizando un kit (Macherey-Nagel), siguiendo las especificaciones del proveedor con el objetivo de obtener DNA de calidad, libre de inhibidores que pueden estar presentes en el suelo. Los primers específicos utilizados en la reacción de PCR fueron: TF-2F (5?ATGTCAAAGAGTGCGAAGAC3?) y TF-2R (5?TATCTTGCTGGTAGGCTGTT3?), diseñados a partir de la región ITS del ADN ribosomal. Las condiciones de ciclado para PCR fueron 35 ciclos de 95 ºC por 1 minuto, 55 ºC por 1 minuto y 72 ºC por 1 minuto. Los productos de DNA y PCR fueron evaluados en cuanto a su cantidad y calidad en nanodrop y gel de agarosa al 1%. Se utilizó como control negativo una muestra de suelo libre de teliosporas de T. frezii.ResultadosDe todas las muestras de suelo fue posible extraer DNA en cantidad y calidad. Todas las reacciones provenientes de suelos del área manisera fueron positivas para la reacción de PCR utilizando primers específicos, obteniendo tamaños de banda de 196 pb.ConclusiónEl método de extracción de DNA y la reacción de PCR muestran resultados promisorios y resultan en el punto de partida para la cuantificación de inóculo en forma precisa y específica, a partir de muestras de suelo que contengan teliosporas de T. frezii.