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En la provincia de Jujuy, el emplazamiento de embalses para generación de energía eléctrica y abastecimiento de agua e irrigación, data de principios del siglo XX. Desde 2016, el Laboratorio de Limnología y Ecología Acuática de la FCA ? UNJu, a través de un convenio institucional, brinda asesoramiento a la Intendencia de los Diques en temas relativos al diagnóstico ambiental, flujo de contaminantes y calidad de agua en el sistema de diques de Jujuy. En este trabajo, se realizó una línea de base limnológica, estudiando la diversidad acuática y las especies indicadoras en el sistema interconectado de diques de Jujuy: Los Alisos, La Ciénaga, Las Maderas y Catamontaña. Se determinaron 23 taxones; la especie más frecuente y abundante fue Ceratium furcoides, seguida en menor densidad por Aulacoseira granulata y el alga verde Staurastrum sp., ambas ausentes sólo en Los Alisos. C. furcoides es una especie invasora, procedente de Brasil, registrada recientemente en la provincia de Jujuy, cuya aparición estaría asociada a una dispersión pasiva a partir de tributarios del río Paraná Superior. Se encontraron diferencias significativas en las métricas obtenidas, en relación a la calidad de agua de los embalses: en La Ciénaga, se obtuvo el mayor índice de diversidad y riqueza, en contraste, la menor riqueza y mayor índice de dominancia se obtuvo en Los Alisos y Las Maderas, donde ya se ha registrado un deterioro ambiental con episodios de mortalidad de peces y emisión de malos olores. Complementariamente, con el objetivo de conocer el nivel de dispersión de C. furcoides, se realizaron relevamientos en ambientes naturales (Lagunas de Yala) donde se encontró que esta especie está presente y domina como especie oportunista, los espejos de agua cuya calidad se ve deteriorada por el uso antrópico, alcanzando grandes densidades (Laguna Rodeo).