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El objetivo fue evaluar el impacto del manejo orgánico (sin uso de pesticidas/ fertilizantes) y convencional sobre el desarrollo de individuos de especies de roedores con diferentes grados de especialización de hábitat (Akodon azarae (Aa), especialista en uso de hábitat, y Calomys musculinus (Cm) y C. laucha (Cl), generalistas). Como herramienta se utilizó la asimetría fluctuante (AF), definida como pequeñas desviaciones al azar de rasgos bilaterales con respecto a la simetría perfecta. Se digitalizaron landmarks tipo I y II en imágenes 2D, utilizando tpsdig. v.2.30. Se colocaron 18 landmarks en 34 mandíbulas de Aa y 20 landmarks en 18 y 34 mandíbulas de Cl y Cm, respectivamente. Fueron digitalizados 19 landmarks craneales en 42 individuos de Aa, 131 de Cm y 21 de Cl. Los landmarks fueron alineados aplicando un modelo de ANOVA Procrustes. Posteriormente, se extrajeron los valores de tamaño y el componente asimétrico de forma y fueron analizados mediante un ANOVA mixto (factores fijos: sexo y manejo, factor aleatorio: establecimiento agrícola). No se observaron diferencias para la interacción ni para los factores por separado para ninguna de las 3 especies. La ausencia de diferencias en AF de cráneos y mandíbulas de las especies generalistas de hábitat entre manejos coincide con los resultados de estudios exomorfológicos previos de AF en patas traseras, mientras que para la especie especialista no. Esto último podría deberse a que el número de individuos analizados fue bajo, o que las estructuras estudiadas presentan una mayor capacidad de resistir el estrés que se pudiera producir durante el desarrollo. Se discuten las diferencias entre el estudio de la AF a través de caracteres exomorfológicos (medidas lineales) y de cráneo y mandíbula (morfometría geométrica), para el análisis del efecto del estrés ambiental sobre individuos de roedores con diferente grado de especialidad de hábitat.