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Ctenomys es el género más diverso de roedores caviomorfos y de los roedores subterráneos del mundo. Se analizó el patrón de cambios de la diversidad morfológica del cráneo y la mandíbula de 41 especies en un contexto filogenético. Se utilizó morfometría geométrica y métodos filogenéticos comparativos para evaluar la distribución de las especies en los filomorfoespacios. El análisis de forma 2D de cráneo y mandíbula se realizó a partir de imágenes laterales en el programa MorphoJ. La señal filogenética para la forma general del cráneo y mandíbula resultó débil (Kmult< 1), lo mismo que para el primer eje de variación (K< 1). La influencia del tamaño resultó significativa en el primer eje del morfoespacio de cráneo (35,72% en PC1) y poco significativa en el de mandíbula (0,25% en PC1). Una vez extraído el efecto del tamaño, la distribución de las especies en el PC1 de cráneo fue determinada por el inflamiento de la bulla, la longitud del rostro y la procumbencia. En el PC1 de mandíbula, las variables más importantes fueron la longitud del diastema, altura del cóndilo, y posición de la cresta masetérica en el eje dorsoventral. La masa corporal mapeada sobre un árbol calibrado mostró una tendencia general hacia la disminución en la mayoría de los nodos, y unos pocos eventos de incremento en nodos externos. Respecto de la forma, el mapeo de los residuales del PC1 mostró cambios en el cráneo en C. lewisi, C. boliviensis, y los grupos torquatus, tucumanus (rostro largo, bulla auditiva pequeña) vs. C. colburni y el grupo opimus. El morfotipo de mandíbula de cóndilo bajo y diastema largo ocurrió en linajes basales mientras que morfologías opuestas ocurrieron especialmente en los grupos opimus y boliviensis. Estos resultados preliminares sugieren que la radiación evolutiva de Ctenomys habría involucrado múltiples eventos de cambio independientes de la filogenia