IBS   24490
INSTITUTO DE BIOLOGIA SUBTROPICAL
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
SECUENCIACIÓN Y ANÁLISIS DEL TRANSCRIPTOMA DE YERBA MATE
Autor/es:
FAY, JESSICA V.; FERRERAS J.; TALAVERA STEFANI L.; MIRETTI M.; LITWINIUK S.; ARGÜELLES C.
Reunión:
Jornada; Jornadas Argentinas de Genética 2021.; 2021
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Genética
Resumen:
El transcriptoma proporciona información directa sobre la expresión génica global en tiempo y espacio específicos. La yerba mate (YM) (Ilex paraguariensis A. St.-Hil 1822) representa el producto de la economía regional más importante del noreste argentino, ubicándose entre las especies de interés industrial con altos niveles de antioxidantes. Sin embargo, son recientes los accesos a la biotecnología y estudios genéticos aplicados a su producción. Nuestro objetivo fue generar un transcriptoma de referencia para YM como base para nuevas investigaciones, desarrollo de programas de mejoramiento y aplicaciones biotecnológicas de esta especie. Generamos un transcriptoma confiable basado en 15 bibliotecas de RNA-Seq de diferentes tejidos de YM. Se consideraron muestras de hojas, saludables y enfermas (rulo de la YM) asociadas a una de la principales plagas del cultivo Gyropsilla spegazziniana, colectadas de plantas adultas crecidas a campo; plántulas enteras de viveros y raíces de plántulas. Un total de 193.897 transcriptos fueron ensamblados y, más del 60% fueron asociados con secuencias de proteínas. Se identificaron 531 transcriptos asociados a síntesis de compuestos antioxidantes, y 8 genes involucrados en pasos iniciales de la biosíntesis fueron validados experimentalmente. El análisis de perfiles de expresión reveló genes con expresión diferencial entre tejidos de YM, validándose experimentalmente esta divergencia mediante q-PCR. El análisis comparativo entre hojas saludables y enfermas de una misma planta, mostró genes de respuesta a estrés biótico regulados positivamente en hojas deformadas. Los transcriptos ensamblados se encuentran disponibles en la base de datos publica NCBI, representando una referencia para los estudios genómicos de I. paraguariensis y estableciendo el contexto para investigar genes candidatos asociados a síntesis de compuestos de interés, respuesta a enfermedades, estrés abiótico e interacciones de microorganismos en la producción de YM.