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Las ranas del género Leptodactylus comprenden un grupo monofilético distribuido por todo el Neotrópico, al este de los Andes. Desde el punto de vista taxonómico, Leptodactylus incluye cuatro grupos de especies, con L. gracilis perteneciente al grupo de L. fuscus. La especie nominal L. gracilis se distribuye en un área extensa que abarca Paraguay, Uruguay, las provincias del centro y norte de Argentina, y el sur de Brasil. En el presente trabajo realizamos una primera aproximación al estudio de su estructura a nivel poblacional, utilizando secuencias de Citocromo Oxidasa subunidad I (COI) (651 pb). Para ello, extrajimos ADN genómico total de muestras de tejidos pertenecientes a ejemplares de L. gracilis, abarcando gran parte de su rango de distribución, siendo luego amplificadas y secuenciadas con oligos específicos para COI. Realizamos un análisis filogenético utilizando máxima parsimonia para observar la posición filogenética de cada uno de los terminales estudiados y posteriormente se calculó p-distance dentro y entre los clados encontrados. Los análisis recuperan tres clados con una marcada estructura geográfica. La topología obtenida, geográficamente estructurada, junto con las distancias genéticas entre los clados, sugirie que L. gracilis podría representar en realidad un complejo de especies. Futuros análisis, involucrando un mayor número de terminales y marcadores moleculares, permitirán visualizar de manera más precisa la estructura genética de las poblaciones actualmente asignadas a la especie nominal L. gracilis.