ESTRUCTURA GENOMICA DEL CLOROPLASTO DE ILEX PARAGUARIENSIS A. ST. HIL.

EZEQUIEL SOSA; DENISSE MAVIS SANCHEZ; DARDO A. MARTI; ADRIÁN TURJANSKY

Erechim

Congreso; VII Congresso Sul-Americano da Erva-Mate, III Simpósio Internacional da Erva-Mate e Saúde e I Feira de Tecnolgia na Indústria Ervateira; 2017

Universidade Regional Integrada do Alto Uruguai e das Missoes

Las diferencias estructurales en los genomas del cloroplasto han demostrado ser poderosos caracteres para comprender las relaciones entre las plantas terrestres debido a los aparentes bajos niveles de homoplasia. El genoma del cloroplasto presenta una estructura, orden y contenido de genes notablemente consistente entre una amplia gama de miembros del reino vegetal. Los genomas de los cloroplastos del género Ilex tienen una estructura bicíclica típica con un arreglo conservado y una divergencia moderada. La longitud total es de aproximadamente de 157.741 pb y hay una región de una sola copia grande (LSC) con 87.109 pb, una copia única pequeña con 18.436 pb y un par de regiones repetidas invertidas (IR) con 52.196 pb. En estudios anteriores basados en el transcriptoma de Ilex paraguariensis y con la premisa de que los cloroplastos se transcriben activamente en las plantas, correlacionamos los transcriptos de Ilex paraguariensis con el cloroplasto de Lactuca sativa y logramos predecir que el cloroplasto ensamblado de I. paraguariensis tendría 152.872 pb de largo, constituido por 51,6% de secuencias codificantes, representando 83 genes codificantes de proteínas, 37 genes de ARNt y 7 genes de ARNr. En el presente trabajo, a partir de datos obtenidos por NGS Illumina del genoma completo de Ilex paraguariensis, realizamos un ensamblado de referencia contra el cloroplasto de Ilex szechwanensis. Del mismo obtuvimos los siguientes genes cubiertos por los datos obtenidos por NGS: tRNA: 37, rRNA: 8, genes de proteínas: 95. Con respecto a las variantes de Ilex paraguariensis contra el genoma de cloroplasto de Ilex szechwanensis observamos un total de 630, de las cuales 340 corresponden a variantes intergénicas, y para las génicas 3 (rps16,ndhF,rps15) Frameshift, 122 Missense, 1 (psbI) stop gained, 93 Sinonima. Presentamos aquí, los resultados del genoma completo del cloroplasto de Ilex paraguariensis.