Evolución y mapeo de elementos transponibles cortos de la familia AuSINE en tomate

SÁNCHEZ D. M.; MARTÍ, D. A.; GRABIELE, M.

Posadas

Congreso; IX Jornadas Científico Tecnológicas de la FCEQyN UNaM; 2015

FCEQyN UNaM

El tomate (Solanum lycopersicum) es el vegetal más ampliamente cultivado a nivel global y un modelo genómico para la familia Solanaceae. Con el fin de conocer la dinámica de SINEs en el genoma de tomate, y evaluar su potencial aplicabilidad como marcadores de mapeo comparativo y selección, en el presente trabajo se analizó la evolución y la distribución del clado AuSINE en esta especie cultivada. Se identificaron por homología 525 miembros de la Familia AuSINE en el genoma de tomate los cuales fueron caracterizados mediante anotación bioinformática con secuencias de referencia y posteriores análisis de distribución, estructurales comparativos y contexto genómico. Se logró determinar la organización cromosómica y la distribución genómica de la Familia AuSINE en el genoma de tomate y se integró la información en un mapa marco. A su vez, el análisis conjunto de la variabilidad y la distribución de la Familia AuSINE en el genoma de tomate permitió generar una hipótesis acerca de su evolución molecular y estimar su impacto sobre los genes y demás regiones genómicas de esta importante especie cultivada.