INVESTIGADORES
UNREIN Fernando
congresos y reuniones científicas
Título:
Diversidad molecular de picocyanobacterias mediante secuenciación masiva
Autor/es:
HUBER, M. P.; CORNEJO, F.; FERRERA, I.; SÁNCHEZ, P.; LOGARES, R.; METZ, S.; LLAMES, M. E.; ACINAS, S.; GASOL, J. M.; UNREIN, F.
Reunión:
Congreso; Congreso Argentino de Limnologia (CAL 2016); 2016
Resumen:
En los últimos años nuevas técnicas moleculares y computacionales permitieron comprender mejor la estructura de comunidades microbianas y su respuesta a cambios ambientales. Particularmente, el empleo de técnicas de secuenciación masiva ha revelado una nueva dimensión de la diversidad bacteriana. Sin embargo, no se ha logrado aún obtener datos precisos sobre la composición de picocyanobacterias. El objetivo de este trabajo fue diseñar cebadores (primers) basados en el gen 16S ADNr para la detección de Synechococcales (Cyanobacteria) mediante el sistema MiSeq de Illumina. Para esto se construyeron in silico bibliotecas genómicas con secuencias completas (FLS) y parciales de las regiones hipervariables V2-V4 y V5-V7 (SS). El análisis de la diversidad filogenéticas (MNDT) y las distancias filéticas y topología (RF) de árboles generados a partir de bibliotecas FLS y SS, revelaron que las regiones V5-V7 son las más adecuadas para el estudio de diversidad de Synechococcales. En base a estos resultados se diseñaron cebadores de las regiones V5-V7 específicos y se secuenciaron 10 muestras ambientales (agua dulce y marina) contemplando variabilidad temporal y espacial. Se obtuvieron 129.789 lecturas, de las cuales el 90% presentaron alta similitud con secuencias de Synechococcales, confirmando así la alta especificidad de los cebadores diseñados. En todos los casos las muestras estuvieron dominadas por pocas OTUs. La mayor riqueza se determinó en ambientes de agua dulce en épocas invernales.