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Los reptiles se desplazan de un sitio a otro por varias razones que se relacionan con la obtención de recursos, como disponibilidad de temperatura, refugio, alimento, etc. Mecanismos como el desplazamiento entre microhábitats y regulación de patrones diarios de actividad, son algunas de las estrategias utilizadas para mantener sus temperaturas corporales dentro de un rango adecuado a pesar de las fluctuaciones ambientales. Estos mecanismos pueden ser aún más restrictivos cuando las condiciones ambientales son desfavorables, como ocurre en condiciones de alta montaña. Investigamos la preferencia y selección de microhábitats específicos y patrones de actividad de Phymaturus williamsi en diferentes épocas del año. Los lagartos se marcaron individualmente y se observaron durante la temporada reproductiva y no reproductiva. Casi la totalidad de los individuos (>90%) se encontraron en rocas, independientemente de la estación. Los lagartos prefirieron rocas basálticas expuestas al sol. El patrón de actividad P. williamsi fue unimodal, con un pico de actividad desde las 13:30h hasta las 15:30h. Los lagartos estuvieron más activos cuando la temperatura del sustrato estaba entre 30 y 35°C. Una mayor frecuencia de individuos se relacionó a Ephedra breana. Sin embargo, la cercanía a la vegetación no influyó. En cambio, el principal factor que controló el patrón de selección de microhábitat y de actividad en P. williamsi parece ser la temperatura del sustrato. Estos resultados contribuyen al desarrollo de planes de manejo y conservación de esta especie con requerimientos de hábitat altamente especializados.