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Los tripanosomátidos son parásitos protozoarios unicelulares que causan muchas enfermedades en animales, incluyendo humanos, y plantas. Estos eucariotas primitivos poseen muchas estructuras y procesos singulares, muchas de las cuales involucran una amplia variedad de helicasas de ADN/ARN específicas. Durante los últimos años hubo grandes esfuerzos para identificar familias de genes asociados con patogenicidad, virulencia o simplemente que fueran indispensables para la supervivencia de los parásitos. Sin embargo, a pesar que las helicasas constituyen una de las superfamilias de proteínas más grandes en la naturaleza, fueron poco estudiadas en tripanosomátidos. Los genomas de T. cruzi, T. brucei y L. major fueron analizados en búsqueda de genes codificantes para helicasas de ADN/ARN. Sólo las secuencias correspondientes a copias alélicas simples fueron elegidas para ser incluídas en el presente análisis. Un total de 328 helicasas putativas fueron identificadas; 204 genes fueron asignados a la Súper Familia 2 (SF2), 42 genes a la Súper Familia 1 (SF1) y 76 genes quedaron sin clasificar. En el caso específico de las helicasas de la SF2, la mayoría de los genes ortólogos fueron encontrados en los tres organismos estudiados, sin embargo, 8 de las 204 helicasas de la SF2 mostraron ser específica de especie. T. cruzi tiene 3 DEAD-box y una DEAH/RHA helicasas específicas, mientras que L. major tiene 3 Swi/Snf2 y T. brucei tiene solamente una, la helicasa RigI. Finalmente, para identificar helicasas que podrían ser utilizadas como blancos terapéuticos, todos los genes obtenidos fueron comparados con aquellos presentes en el genoma humano. Cuarenta y dos helicasas fueron encontradas no estando representadas en el genoma humano, constituyendo 16 grupos ortólogos. En el caso específico de los Kinetoplástidos, la presencia de estructuras únicas y procesos biológicos involucrando helicasas específicas, señala estas súper familias de proteínas como blancos potenciales para drogas anti-parasitarias.