COMO SOBREPASAR EL TSUNAMI DE VARIANTES HALLADAS POR WES: IMPORTANCIA DEL FACTOR HUMANO.

CARCIONE, MICAELA; FLORENCIA GILIBERTO; LEONELA LUCE; MAZZANTI, CHIARA

Jornada; SEGUNDAS JORNADAS INFIBIOC . AVANCES EN LA INVESTIGACIÓN CIENTÍFICAS Y SU IMPACTO EN LA SALUD; 2019

Facultad de Farmacia y Bioquímica UBA

COMO SOBREPASAR EL TSUNAMI DE VARIANTES HALLADAS POR WES: IMPORTANCIA DEL FACTOR HUMANO.Carcione, Micaela1,2; Mazzanti, Chiara1,2; Luce, Leonela1,2 y Giliberto, Florencia1,2.1Universidad de Buenos Aires; Facultad de Farmacia y Bioquímica; Cátedra de Genética. Buenos Aires, Argentina.2CONICET - Universidad de Buenos Aires; Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo (INIGEM). Buenos Aires, Argentina.mica.carcione@gmail.comIntroducción: Las Distrofinopatías son enfermedades neuromusculares de herencia recesiva ligada al cromosoma X causadas por variantes en el gen DMD. Las alteraciones moleculares en este gen son mutaciones pequeñas, en el 20% de los casos, detectadas por secuenciación de exoma completo (WES). El uso de técnicas de secuenciación masiva en paralelo (NGS) permite la obtención de un gran caudal de datos que son analizados por softwares bioinformáticos, pero este análisis puede conllevar a errores en la nomenclatura de las variantes encontradas. Por ello, es importante utilizar herramientas que permitan analizar los datos crudos. A su vez, es de suma importancia validar las variantes encontradas mediante una técnica diferente.Objetivos: El presente trabajo busca enfatizar la importancia del factor humano para detectar errores de nomenclatura.Metodología: Se analizó por WES una cohorte de 106 pacientes con diagnóstico clínico presuntivo de distrofinopatía y MLPA negativo. Se implementó el software Integrative Genomics Viewer (IGV) para el análisis de los datos crudos. Se empleó la técnica de secuenciación de Sanger para corroborar las variantes encontradas por WES.Resultados: Se logró encontrar la variante patogénica causante de la patología en el 86% de los pacientes, mientras que en el 9% se encontraron alteraciones moleculares en genes asociados a otras distrofias musculares. Se destacan 2 pacientes con variantes nomencladas erróneamente que no se correspondían con las observadas al analizar los datos crudos mediante el software IGV. Para uno de estos pacientes, se encontró un complejo rearreglo y para corroborarlo se diseñaron primers específicos para la misma. Finalmente, al corroborar las variantes por Sanger se logró nomenclar de manera correcta a las mismas.Conclusiones: Se destacó la importancia del análisis de los datos crudos, la validación de las variantes y la experiencia de los científicos para detectar errores de nomenclatura y brindar resultados confiables.