Diseminación diferencial de los genes cassettes aadA-like entre taxones

QUIROGA MP; GALÁN AV; CENTRON D; ÁLVAREZ VE

Congreso; XIV Congreso Argentino de Microbiología, XXIII Congreso Latinoamericano de Microbiología (CAM/ALAM 2016); 2016

Asociación Argentina de Microbiología

Los genes cassettes son elementos genéticosmóviles asociados a la transferencia horizontal genética insertos en Integrones.El sistema integron/genes cassettes permitea las bacterias capturar y expresar genes cassetteslos cuales son marcos abiertos de lectura (ORF) con un sitio de recombinacióndenominado sitio attC. Los genes cassettes aadA-like son unos de los genes de resistencia más dispersos en laclínica y se cree que su gen ancestro se originó previo a la era antibiótica. Eneste estudio evaluamos la asociación significativa entre los genes cassettes aadA-like más prevalentes, losrearreglos más frecuentes de la zona variable (ZV) del integrón donde estáncontenidos y las especies bacterianas que los contienen. Para ello usamos labase de datos INTEGRALL con el fin de obtener los registros de los genes cassettes aadA-like más frecuentes (aadA1, aadA2 y aadA5), los cuales en unanálisis de máxima similitud se ubicaron en tres en grupos diferentes,  la clase de integrasa a la cual estánasociados, los rearreglos de la zona variable de cada uno y la especie bacterianaque contiene al integrón. Encontramos un total de 484 registros del gen cassette aadA1, 397 de ellos (82%) asociadosa integrasa de clase 1,  71 (14%) aintegrasa de clase 2  y 16 (3%) a otrasintegrasas (∆IntI1 o groel/intI1) conun  total de 79 especies que lo contienen,siendo la más frecuente Escherichia coliy sus plásmidos con el mayor cantidad de registros (164), seguida de lasespecies Acinetobacter baumannii y Pseudomonas aeruginosa con 96 y 45registros respectivamente,  el arreglomás frecuente de la ZV de integrones de clase 1 fue dfrA1-aadA1 seguido del gen cassetteaadA1 como único gen cassette enla ZV.  Para integrones de clase 2 elarreglo más común es el de dfrA1-sat2-aadA1,seguido de sat2-aadA1. Para el gen cassette aadA2 encontramos un total de264 registros, 258 (97%) de ellos correspondientes a IntI1, y 6 correspondientes a otras integrasas 2,27%, ninguna declase 2. Este gen cassette está contenidoen 60 especies, de nuevo siendo la más predominante la enterobacteria Escherichia coli con 69 registros. Elarreglo más frecuente corresponde al gen cassetteaadA2 como único gen cassette dela región variable, seguido de dfrA12-orfF-aadA2.El gen cassette aadA5 tiene un totalde 137 registros, todos correspondientes a integrasa de clase 1. Este gen cassette está contenido en 34 especies,volviendo a ser la más prevalente la especie Escherichia coli  con 77registros, la cual presenta en su mayoría el arreglo dfrA17-aadA5 seguido del gen cassetteaadA5 como único gen de la región variable. La mayoría de las especies que contienena estos genes cassette sonenterobacterias clínicas, seguidas por bacterias no patógenas oportunistas. Encontramosque hay una correlación fuerte (r= 0,98) entre la especie Escherichia coli y lo tres genes cassettes aadA-like más frecuentes en los integrones clínicos.