IMPAM   23988
INSTITUTO DE INVESTIGACIONES EN MICROBIOLOGIA Y PARASITOLOGIA MEDICA
Unidad Ejecutora - UE
artículos
Título:
Multidrug resistant (MDR) Klebsiella pneumoniae clinical isolates: a zone of high heterogeneity (HHZ) as a tool for epidemiological studies
Autor/es:
RAMIREZ M.S.; XIE G. ; MARSHALL S.H.; HUJER K.M.; CHAIN P.; BONOMO R.A.
Revista:
CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTION
Editorial:
WILEY-BLACKWELL PUBLISHING, INC
Referencias:
Año: 2012 p. 254 - 254
ISSN:
1198-743X
Resumen:
La capacidad de K. pneumoniae (Kp) de diseminarse rápidamente junto con la ocurrencia de aislamientos multirresistentes (MDR) convierten a esta bacteria en un importante problema en salud publica. En el presente trabajo presentamos el uso de un mapa de restricción de alta resolución para llevar a cabo la comparación del genoma total de aislamientos de Kp clínicamente relevantes.Se realizó el mapa de restricción de alta resolución (mapa óptico) del genoma total de  3 cepas (JHCK1, VA 360, y 1.53) que poseían diferentes fenotipos de resistencia. Para llevar a cabo los estudios genómicos comparativos utilizando mapas de restricción de alta resolución se utilizaron los genomas totales de las cepas de Kp depositados en el GenBank (MGH 78578, NTUH-K2044, KCTC 2242). Al realizar el estudio comparativo de los diferentes mapas se observó que los genomas de las 6 cepas de Kp analizadas son altamente homogéneos. A pesar de la elevada homogeneidad a lo largo del todo el genoma, se evidenció una región claramente heterogénea entre las diferentes cepas que denominamos zona alta heterogeneidad (ZHA). Utilizando la cepa MGH 78578  como referencia se identificaron los extremos de la ZHA, estando la zona delimitada por los genes yedA y metG.Utilizando los genomas totalmente secuenciados se analizo la estructura de las ZHAs presentes en los mismos en las cuales se identificaron inversiones, inserciones, deleciones, presencia de integrasas, transposasas, y otros elementos genéticos. Del análisis de secuencias se pone en evidencia que dicha zona esta compuesta por regiones blanco que participan y favorecen inserciones y otros tipos de arreglos genéticos.Concluimos que el uso de los mapas de restricción de alta resolución de nuevas cepas, de las cuales no esta el genoma disponible, puede servir como un primer tamizaje para estudios epidemiológicos y para el comienzo de la caracterización de la cepa. Dado que la ZHAs es una región característica dentro del genoma, podría ser utilizada como característica individual de aislamientos en estudios epidemiológicos.
rds']