CIVETAN   23983
CENTRO DE INVESTIGACION VETERINARIA DE TANDIL
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Primer genoma secuenciado de una cepa argentina de *Streptococcus agalactiae* aislada de un bovino con mastitis
Autor/es:
LORENZO LÓPEZ JR; CADONA, JS; BUSTAMANTE AV; HERNANDEZ, LB; SANSO AM
Lugar:
Bueno Aires
Reunión:
Congreso; XLVIII Congreso Argentino de Gnética.; 2020
Resumen:
*Streptococcus agalactiae* (EGB) es un importante patógeno de bovinos, causante de mastitis clínica y subclínica, lo cual impacta en la salud animal y la calidad de la leche y, por ende, afecta la producción láctea. Es también un importante patógeno humano que puede causar infecciones graves, principalmente, en neonatos y personas inmunocomprometidas y ancianos. En el marco de un proyecto que comprende el análisis genómico comparativo de cepas de *S. agalactiae* y con el objetivo de identificar regiones genómicas que podrían ser marcadores predictivos de virulencia, se obtuvo la primera secuencia genómica de una cepa argentina de *S. agalactiae* aislada de un bovino con mastitis.El ADN se obtuvo mediante el kit de extracción de ADN genómico Wizard (Promega) y la calidad del mismo se evaluó mediante espectrofotometría. La secuenciación del genoma se realizó mediante la plataforma MiSeq (Illumina, Omega Bioservices). A partir de los datos de secuenciación, se determinó el secuencio-tipo (ST) del aislamiento mediante *Multilocus sequence typing* (MLST). Se identificó un nuevo alelo en el *locus sdhA*, identificado como *sdhA*-153 por la base de datos PubMLST (https://pubmlst.org/sagalactiae/). Consecuentemente, el aislamiento presentó un ST también novedoso, ST-1640. Los datos de secuenciación se cargaron en la plataforma web Galaxy. Las *reads* fueron ensambladas *de novo* usando SPAdes. Como resultado, el genoma se ensambló en 150 *contigs*, con un valor N50 de 39.265 pb y una longitud máxima de *contig* de 104.508 pb. El genoma presentó una longitud aproximada de 2,3 Mb, con un contenido de G+C de 35,61%, y una profundidad de cobertura promedio de 167,35x. Se utilizó Prokka para la anotación del genoma y se predijeron 2.312 genes que codifican proteínas (Prodigal V2.6.3).