La evolución de la Leucemia Linfoblástica Aguda pediátrica involucra la desregulación de varios pseudogenes y ARN no codificantes

RICCHERI, CECILIA; GUIÑAZU, KARINA; SCHUTTENBERG, VIRGINIA; COTIGNOLA, JAVIER; ORELLANO, LAURA; GUTIERREZ, MARCELA; VAZQUEZ, ELBA; ABBATE, MERCEDES; ALONSO, MARTA; AVERSA, LUIS; GUERON, GERALDINE

Ciudad de Mendoza

Congreso; XXIV Congreso Argentino de Hematologia; 2019

Sociedad Argentina de Hematologia

Los pacientes diagnosticados con Leucemia Linfoblástica Aguda (LLA) se estratifican en grupos de riesgo según los parámetros bioquímicos, citogenéticos, moleculares y la respuesta temprana al tratamiento. Si bien se logró un gran avance en la eficacia del tratamiento y las tasas de sobrevida para la LLA pediátrica, la evolución de la enfermedad todavía es impredecible en muchos casos. Una estrategia prometedora para comprender mejor la biología de las LLA pediátricas es estudiar el transcriptoma de las células leucémicas para identificar los perfiles de expresión génica que definen la evolución. Un ejemplo que destaca la importancia de este tipo de estudios es la identificación de un subtipo de LLA (LLA Phi-like) que se caracteriza por un perfil de expresión génica similar al de las LLA Phi+, aunque la proteína de fusión BCR-ABL1 está ausente.En el presente estudio tuvimos como objetivo identificar perfiles de expresión génica asociados con el grupo de riesgo y que pudieran predecir la evolución de la enfermedad.Para lograr esto, recogimos muestras por aspiración de médula ósea en el momento del diagnóstico. El ARN total se purificó utilizando el protocolo TRIZOL. Se realizó un análisis de transcriptoma (RNAseq) de 28 pacientes pediátricos con LLA de novo utilizando un sistema HiSeq 2500 (Illumina). Las características clínico-patológicas fueron evaluadas y registradas por oncohematólogos capacitados. Se realizó un análisis diferencial de la expresión génica entre los grupos de riesgo y la aparición de eventos (recaída y/o fallecimiento). Consideramos que los genes se expresaban diferencialmente si el valor p≤0,05 (ajustado por test múltiples mediante FDR). Debido a que la aparición de eventos podría estar asociada con el grupo de riesgo y, en consecuencia, con los protocolos de tratamiento, realizamos análisis multivariados, incluyendo el grupo de riesgo como covariable. Todos los análisis se realizaron con la plataforma R/Bioconductor.Encontramos 16 transcriptos expresados diferencialmente entre pacientes que presentaron recaída o muerte (n = 5) y que no tuvieron eventos (n = 23). Curiosamente, el 62% de los genes con expresión diferencial 10/16 correspondieron a pseudogenes (8/10) y ARN no codificantes (2/10). Todos ellos muestran una gran desregulación en su expresión (Log2FC>|20| y p.ajustado