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La enfermedad de Chagas causada por el Trypanosoma cruzi, sigue siendo el mayor problema de salud pública en Latino América. Se ha descripto que el T. cruzi tiene una estructura clonal y las cepas infectivas son a menudo multiclonales. Esta variabilidad genética del parásito en un mismo individuo determina un tropismo diferencial de estos clones a los diferentes órganos del huésped; es la distribución de estos clones la que podría influir o determinar el curso clínico de la enfermedad. Algunas cepas prefieren parasitar células musculares (esqueléticas o cardíacas); otras prefieren células mononucleares fagocíticas; y un tercer grupo prefiere aún otros tipos de tejidos, entre los que se pueden nombrar al tejido nervioso, tejidos del sistema reproductor, hígado, bazo y aún, tejido adiposo. El objetivo del presente estudio fue evaluar la etapa crónica cardíaca de la enfermedad de Chagas en ratones infectados con diferentes cepas de T. cruzi. Se infectaron 60 ratones albinos suizos con 50 tripomastigotes/ratón de T. cruzi cepa Z12 y Tulahuen, a los que se analizó mediante parasitemia, sobrevida, electrocardiografía e histopatología de músculo cardíaco (MC) y esquelético (ME) a los 90, 180, 270 y 360 días post infección (dpi). La máxima parasitemia se observó a los 28 y 21 dpi en las cepas Z12 y Tulahuen respectivamente, negativizándose ambas a los 42 dpi y presentando Tulahuen una mayor cantidad de parásitos. La sobrevida fue para Z12: 12% y Tulahuen: 14%. La electrocardiografía mostró mayor porcentaje de alteraciones en ratones infectados con la cepa Tulahuen. MC y ME presentaron alteraciones histopatológicas que se fueron profundizando con la evolución de la infección. En ME se encontraron alteraciones similares a las encontradas en MC, pero más intensas. Pudimos determinar que uno de los factores que determinarían el desarrollo de la enfermedad de Chagas son las diferentes cepas que pueden infectar al huésped, ya que los parámetros observados en el presente trabajo variaron de acuerdo a la cepa infectante.