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Se analizaron las variaciones en el estado de preservación de diatomeas y moluscos a lo largo de dos testigos sedimentarios (Holoceno tardío) extraídos de las lagunas Hinojales-San Leoncio (37°23ʼ24?S; 57°24ʼ17?O) y Nahuel Rucá (37°37ʼ21?S; 57°25ʼ42?O) ubicadas en el sudeste de la provincia de Buenos Aires. Se cuantificó el grado de fragmentación y de desgaste superficial de los dos indicadores cada 1-2 cm seleccionando una especie target, a fin de independizarse de las variaciones debidas a factores intrínsecos. Para los moluscos se analizó Heleobia parchappii (d?Orbigny) y para las diatomeas Cyclotella meneghiniana Kützing, las que presentaron el registro más completo en ambas sucesiones. La fragmentación de ambos indicadores decreció hacia el tope de los testigos. Por el contrario, el desgaste presentó patrones inversos: las diatomeas tuvieron mayor grado de desgaste en los niveles más antiguos, mejorando hacia el tope de ambos testigos, en tanto que los moluscos presentaron un mayor grado de desgaste en los niveles superiores. Las variaciones en la preservación coincidieron con cambios en la composición taxonómica de los ensambles, lo que indicaría una influencia de los factores ambientales en la preservación. La disminución en el grado de fragmentación hacia el tope puede explicarse por una menor alteración mecánica como consecuencia de un enterramiento más rápido, lo que está avalado por un incremento en la tasa de sedimentación. Los patrones opuestos de desgaste podrían deberse a una respuesta diferencial de los dos indicadores a factores químicos y/o biológicos del ambiente, como consecuencia de su distinta estructura y composición mineralógica.