INVESTIGADORES
MARTIN Osvaldo Antonio
congresos y reuniones científicas
Título:
Una imagen dice más que mil palabras: Validación gráfica de proteínas
Autor/es:
MARTÍN, OSVALDO; VILA, JORGE; SCHERAGA H.A.
Lugar:
Buenos Aires
Reunión:
Congreso; XL reunión de la Sociedad Argentina de Biofísica; 2011
Resumen:
Las diferencias entre desplazamientos químicos (DQ) de 13 C(alfa) observados y calculados pueden ser usadas para detectar defectos locales en proteínas. Por esta razón previamente desarrollamos CheShift, un servidor-Web para validación de estructuras de proteínas. Una característica altamente deseable de un método de validación de proteínas es la capacidad de detectar defectos locales y no solo problemas globales. Por ello ahora presentamos CheShift-2 (www.cheshift.com), en el cual se implementó una interfaz gráfica de usuario que permite visualizar tales defectos fácilmente. A fin de ilustrar la habilidad de CheShift-2 de localizar defectos estructurales, a nivel de residuo seleccionamos un conjunto de proteínas marcadas en el Protein Data Bank como obsoletas y sus correspondientes sucesoras. Lasentradas en el PDB (coordenadas y datos experimentales) son marcados como obsoletas cuando los autores recolectan nuevos datos o re-refinan las estructuras. Las entradas obsoletas suelen ser reemplazadas por nuevas entradas que reciben un nuevo PDB ID.