Estudio de los determinantes genéticos de rasgos asociados a la persistencia ambiental de Escherichia coli en arroyos urbanos

SARACENO MARTIN; FRANKEL NICOLÁS; GRAZIANO MARTIN

Taller; 4to Taller de la Red colaborativa en Ecología Microbiana Acuática en América Latina; 2024

Red Microsudaqua

La persistencia extendida de E. coli en aguas superficiales es un fenómeno de reciente documentación. Los mecanismos fisiológicos que la permiten, así como sus bases genómicas, son escasamente descriptos. Se hipotetiza que los grupos intraespecíficos A y B1 serían ecológicamente más generalistas, con mejor fitness para habitar ambientes secundarios. En un estudio previo, caracterizamos la tasa de crecimiento planctónica y la capacidad formadora de biofilm, dos rasgos asociados a la persistencia ambiental, en aislamientos de E. coli de los distintos grupos filogenéticos obtenidos de una cuenca con un elevado grado de degradación ecológica. Los ensayos se realizaron empleando aguas del mismo origen. Sólo A y B1 exhibieron crecimiento positivo, mientras que la capacidad formadora de biofilm fue significativamente mayor para B1. También se observó una importante variabilidad dentro de cada grupo. Con el objetivo de identificar determinantes genéticos vinculados a estos rasgos, se seleccionaron 30 aislamientos pertenecientes mayormente a los grupos filogenéticos A y B1, y se secuenciaron sus genomas. Tras ensamblar a los mismos, se determinó el contenido de genes de virulencia y de resistencia antibiótica. La tasa de crecimiento planctónica correlacionó negativamente con la cantidad de factores de resistencia antibiótica (r=-0.50, p