Cambio en el codigo genetico y alto contenido de at en genomas plastidicos de dos plantas holoparasitas (Balanophoraceae)

ROULET MARIA EMILIA; GARCIA LAURA EVANGELINA; CERIOTTI LUIS FEDERICO; SANCHEZ PUERTA MARIA VIRGINIA

Ciudad Autonoma de Buenos Aires

Congreso; III Reunion Argentina de Biologia Evolutiva; 2019

La familia Balanophoraceae (orden Santalales) comprende 14 geeneros de plantas holoparasitas de raices (i.e. plantas no-fotosinteticas y completamente dependientes de su hospedador). En el presente estudio, se ensamblo el genoma plastidico completo y parcial de Ombrophytum subterraneum y Lophophytum mirabile (Balanophoraceae), respectivamente, a partir de la secuenciacion masiva de ADN total con la tecnologia Illumina. El ensamble de las regiones plastidicas se llevo a cabo en base a las lecturas apareadas utilizando diversas estrategias debido a la complejidad de dicha tarea. Al igual que en otras angiospermas no-fotosinteticas, los genomas plastidicos se caracterizaron por presentar un alto grado de reduccion en tamaño y contenido genico, y altos niveles de contenido de AT. Las regiones plastidicas de L. mirabile y O. subterraneum mostraron un contenido de AT de 79,55% y 85,9% en promedio, respectivamente, lo cual dificulto la secuenciacion y el posterior ensamble. Los genes que codifican ARN ribosomal y diversas proteinas fueron identificados por genomica comparativa y mostraron altas tasas de sustitucion. A partir de la comparacion de las secuencias genomicas y del transcriptoma de L. mirabile obtenido por RNAseq, no se observo edición en los transcriptos plastidicos de L. mirabile. Además, se identifico un cambio en el codigo genetico diferente, en el cual el codon TGA (tipicamente un codon de stop) codifica para triptofano. Este representa el segundo cambio en el codigo genetico en genomas plastidicos de plantas terrestres.