IDENTIFICACIÓN DE LAS SEÑALES MOLECULARES QUE GUÍAN LA EDICIÓN DEL ARN EN MITOCONDRIAS DE ANGIOSPERMAS

EDERA, AA; SANCHEZ PUERTA, MV

Rosario

Simposio; Simposio de Genomica Funcional de Plantas; 2017

En las mitocondrias de las plantas, la expresión génica está sujeta a un proceso post-transcripcional llamado edición del ARN. En localizaciones muy específicas de ARNs, la edición convierte citocinas en uridinas. Estas citocinas ?editadas? son llamadas sitios de edición. Aunque la maquinaria de edición no está completamente caracterizada, ésta contiene diferentes clases de proteínas codificadas en el núcleo celular. Ellas se enlazan en las cercanías de una citocina objetivo, y reclutan enzimas que probablemente catalizarían una deaminación sobre el objetivo. Parte de la especificidad del proceso se debe a la presencia de señales moleculares en los alrededores de cada sitio de edición. Estas señales siguen sin ser completamente identificadas. Como una multitud de proteínas están involucradas en la edición, dichas señales moleculares son mucho más complejas que simples consensos alrededor de cada sitio de edición. Para identificar esta señales, hemos propuesto un método computacional basado en la estimación de modelos probabilísticos desde genomas. Utilizando genomas mitocondriales de diferentes angiospermas con sus sitios de edición anotados, el modelo estimado desde ellos logró capturar las señales moleculares. Para evaluar la detección de estas señales, el modelo fue utilizado para predecir los sitios de edición de diferentes genomas. Los resultados mostraron precisiones del ~80%. Utilizando técnicas de teoría de la información, las señales capturadas por el modelo pudieron ser visualizadas mediante un logo de secuencia. Este logo muestra cuáles posiciones en los alrededores de un sitio de edición son parte de la señal reconocida por las proteínas de edición.