DESARROLLO DE MARCADORES MOLECULARES MICROSATéLITES PARA TRICHLORIS CRINITA, UNA GRAMíNEA FORRAJERA DEL MONTE ARGENTINO

KOZUB, C.; CAVAGNARO PABLO FEDERICO; CAVAGNARO J.B.; QUARÍN C.

San Juan

Congreso; 2da. Reunión Conjunta de Sociedades de Biología de la República Argentina; 2011

Soc. de Biología de Cuyo

Trichloris crinita (Poaceae, Chloridoideae), es una de las gramíneas forrajeras C4 másimportantes de la región fitogeográfica del Monte debido a su buena calidad forrajera, suextensa área de distribución y su resistencia a sequía. Estudios previos en una colección de 24accesiones de T. crinita demostraron marcadas diferencias a nivel fisiológico, morfológico y deproductividad forrajera, con variaciones para esta ultima de hasta 10 veces, considerando losgenotipos de mayor y menor productividad. El conocimiento de las bases genéticas quecondicionan estos caracteres y su eventual manipulación contribuirían al uso racional y optimode las pasturas forrajeras nativas del Monte. Sin embargo, los estudios para generar dichoconocimiento requieren de herramientas moleculares que, hasta la fecha, no están disponiblesen esta especie. La disponibilidad de marcadores moleculares basados en PCR, robustos ycodominantes, como los microsatélites o SSR (Simple Sequence Repeats), permitiría asistir enel manejo de bancos de germoplasma, programas de mejoramiento y estudios genéticos deTrichloris. Con el objetivo de desarrollar marcadores SSRs para esta especie, se buscaron –mediante herramientas bioinformáticas- secuencias microsatélites en 25.416 secuencias deADN (correspondientes a ~14 Mbp de ADN) disponibles en NCBI (National Center forBiotechnology Information) de especies cercanamente emparentadas a Trichloris,principalmente de los géneros Chloris, Cynodon y Eleusine, todas especies de la misma tribu(Cynodonteae) y sub-tribu (Eleusininae) que Trichloris. En total se detectaron 5072 secuenciasmicrosatélites con un mínimo 12 nucleótidos y 3 repeticiones del motivo basico. Entre losSSRs detectados predominaron los trinucleotidos (51%), dinucleotidos (~25%) ytetranucleótidos (16%), correspondiendo a penta y hexanucleotidos menos del 8% del total.Sin embargo, cuando se analizaron por separado secuencias genómicas y las de ESTs(Expressed Sequence Tag) se observó predominancia de dinucleótidos (63%) en las primerasy de trinucleótidos (61%) en los transcriptos. Se seleccionaron 100 SSRs que presentabanmayor número de unidades repetitivas, a partir de cuyas secuencias se diseñaron cebadoresque se evaluaron en reacciones de PCR con ADN de Trichloris crinita y separación porelectroforesis en gel de agarosa. Resultados preliminares indican que una fracción significativade los marcadores SSRs desarrollados son transferibles a Trichloris crinita.