Análisis de funciones celulares mediante el desarrollo de un modelo computacional basado en la combinación de ?agentes? y ecuaciones diferenciales.

MAYORGA LS; ARIAS R; VIA, MATÍAS A.; CEBRIAN, I; PAVAROTTI, MA; FLORES, G

Mendoza

Jornada; XXV Jornadas de Investigación de la UN de Cuyo; 2018

UN Cuyo

El transporte intracelular es un proceso clave para la célula eucariota. Numerosas substancias necesitan ser llevadas de una organela a otra a lo largo de las vías endo y exocíticas. Hoy se conocen cientos de factores que son necesarios para esta función celular. Sin embargo, el modo en que las macromoléculas pasan de un compartimento a otro sigue siendo motivo de controversia. En este proyecto hemos desarrollado una plataforma computacional utilizando la combinación de modelización basada en agentes con ecuaciones diferenciales para simular transporte intracelular en la vía endocítica. Esta plataforma permite simular la naturaleza dinámica de las estructuras intracelulares que se mueven, cambian de forma, interaccionan, se fusionan y dividen y al mismo tiempo son base de una compleja red de interacciones moleculares y reacciones químicas. En una primera etapa hemos modelizado el metabolismo de un gangliósido. El modelo así generado reproduce adecuadamente las observaciones experimentales previamente publicadas por nuestro laboratorio y otros grupos de investigación. En una nueva etapa esperamos modelizar procesos que actualmente nuestro grupo estudia de modo de utilizar esta herramienta para organizar las observaciones experimentales en modelos integrados de transporte. Nuestra expectativa es que la plataforma y los modelos generados sean útiles para otros biólogos celulares trabajando en transporte intracelular y en otros campos de la Biología Celular.