Identificación de un atributo molecular unificador en la unión de proteínas: hacia el diseño racional y la reingeniería de drogas

ACCORDINO S.; RODRIGUEZ FRIS J.; SIERRA M.; MORINI M.; ALARCÓN L.; APPIGNANESI G.; FERNÁNDEZ A.

Congreso; XVIII Congreso Argentino de Fisicoquímica y Química Inorgánica; 2013

Para prevalecer en agua, las proteínas solubles deben proteger sus puentes de hidrógeno del backbone (backbone HBs) del efecto disruptivo del ataque del agua, agrupando residuos no polares de sus cadenas laterales alrededor de estos HBs [1]. Esta exclusión del agua circundante o efecto de arropamiento (wrapping [1]) constituye por lo tanto una correlación de tres cuerpos que a su vez modula la constante dieléctrica local, incrementando de esta manera la contribución electrostática de la interacción, y así estabilizando el HB. Por su parte, los HB insuficientemente arropados, llamadas dehidrones [1], representan sitios vulnerables que resultan ?pegajosos? al promover interacciones intermoleculares entre proteínas de modo de completar el arropamiento o contenido hidrofóbico local. Así, dichos defectos de arropamiento constituyen un motivo clave para identificar sitios de unión. En este contexto, la integridad de la interfase de un complejo biomolecular (ya sea cuando una proteína se une a otra proteína ó a una molécula pequeña) se vuelve extremadamente dependiente de la cooperatividad intermolecular basada en correlaciones de tres cuerpos.