Control epigenético mediado por un ARN largo no codificante del gen regulador de la ramificación BRC1

ARIEL, FEDERICO D.; MAMMARELLA, FLORENCIA; LUCERO LEANDRO E.

Workshop; Biología Celular y Molecular del ARN; 2018

En la planta modelo Arabidopsis thaliana, el número de ramificaciones está controlado por un gen que codifica para un factor de transcripción de la familia TCP,llamado BRANCHED 1 (BRC1). BRC1 bloquea el desarrollo de las yemas axilares, reduciendo el número resultante de ramas. La transcripción de BRC1 es regulada pordiferentes vías de señalización endógenas y estímulos externos, que modulan el número final de ramas de la planta. En este trabajo estudiamos la regulación a nivelepigenético del gen BRC1. El silenciamiento del ARN largo no codificante APOLO mediante ARN de interferencia resulta en un mayor número de ramificaciones quelas plantas salvajes y una acumulación menor del ARNm de BRC1. Por otro lado, el análisis histoquímico de plantas transformadas con el promotor de APOLO seguidodel gen reportero GUS, sirvió para determinar que APOLO se expresa en las yemas axilares del tallo, corroborando medidas de ARN. Notablemente, mediante latécnica de ChiRP-seq, hemos observado que BRC1 es un blanco directo de APOLO. Además, la interacción de APOLO coincide con la formación de un dúplex ADN-ARNconocido como R-loop, indicando que APOLO reconoce el locus de BRC1 por complementariedad de secuencia. La existencia de un bucle de la cromatina abracandola región promotora de BRC1 sugiere que APOLO regula de manera directa la conformación tridimensional del locus de BRC1 en respuesta a estímulos que modulen laformación de ramificaciones del tallo en Arabidopsis.