Análisis evolutivo del ARN largo no codificante intergénico APOLO en la familia Brassicaceae

IBARRA, VIRGINIA; LUCERO, LEANDRO E.; ARCE, AGUSTIN; ARIEL, FEDERICO D.

Workshop; Biología Celular y Molecular del ARN; 2018

La publicación de secuencias de genomas completos de numerosas especies de plantas ha permitido profundizar el estudio a nivel molecular de los mecanismos evolutivos que promovieron la diversificación en Angiospermas. Recientemente, las tecnologías de secuenciación masiva contribuyeron a la identificación de numerosos transcriptos largos no codificantes (ARNlnc); algunos de los cuales han sido involucrados en la regulación de la expresión génica a diferentes niveles. Por ejemplo, el ARNlnc intergénico APOLO de Arabidopsis thaliana es capaz de modular la conformación tridimensional de la cromatina. Sin embargo, poco se sabe acerca de la evolución de esta clase de transcriptos. En este proyecto intentamos abordar desde una perspectiva evolutiva, la posible conservación a nivel molecular y funcional en la familia Brassicaceae de APOLO y los complejos ribonucleoproteicos en los que participa. Los análisis filogenéticos realizados indican que existen otros miembros de APOLO en A. thaliana, al igual que en otras dos especies del mismo género, A. lyrata y A. halleri; lo que sugiere un origen reciente en la familia. Además, comparativamente, en A. thaliana existe un menor número de miembros de APOLO, lo que parece concordar con la reducción del genoma que ha sufrido particularmente en regiones intergénicas. Considerando el rol de APOLO en la modulación topológica de la cromatina a nivel local, intentaremos analizar en A. lyrata la posible conservación de esta importante función.