Búsqueda de genes de Arabidopsis potencialmente regulados a nivel de la conformación tridimensional de la cromatina y asociados a repeticiones invertidas generadoras de siRNA

CAMBIAGNO D.A.; ARCE A.L.; MANAVELLA, P.A.; GAGLIARDI, D.

Workshop; II Reunión Argentina de Biología de ARNs no codificantes; 2018

Existe un gran número de procesos capaces de regular la expresión génica, entre ellos el control de la conformación tridimensional de la cromatina a escala génica ha recibido gran interés en el último tiempo. A excepción de algunos casos particulares, es poco lo que se conoce sobre los mecanismos moleculares involucrados y su impacto a nivel genómico. En nuestro grupo hemos estudiado un gen de girasol cuya conformación tridimensional regularía su expresión y estaría asociada a la metilación del ADN en tres regiones. Estas modificaciones serían guiadas por pequeños RNA (siRNA) en parte resultantes del procesamiento de un transcripto originado corriente arriba del gen. Esta región posee una repetición invertida capaz de producir una estructura tallo-hoja. Dicha evidencia motivó la búsqueda de mecanismos análogos de regulación de la conformación tridimensional de la cromatina en el genoma de la planta modelo Arabidopsis thaliana. Esta búsqueda permitió encontrar un gran número de genes que poseen repeticiones invertidas cercanas. Un gran número de estos elementos son blanco de siRNA y varios de los genes cercanos presentarían otras regiones también reconocidas por estas moléculas. A los fines de verificar experimentalmente las predicciones se seleccionaron genes candidato involucrados en floración y se evaluó la variación natural de las regiones invertidas cercanas y su asociación con la floración de diferentes accessions.