IBBM   21076
INSTITUTO DE BIOTECNOLOGIA Y BIOLOGIA MOLECULAR
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Efecto del segundo mensajero guanosina penta/tetrafosfato ((p)ppGpp) sobre la expresión de proteínas en Bradyrhizobium diazoefficiens
Autor/es:
ITURRALDE, ESTEBAN TOMÁS; COLLA, DELFINA; PÉREZ GIMÉNEZ, JULIETA; COTABARREN, AIXA
Lugar:
Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Reunión:
Congreso; XV Congreso Argentino de Microbiología (CAM 2019); 2019
Institución organizadora:
Asociación Argentina de Microbiología
Resumen:
Cuando al rizobio simbionte de soja B. diazoefficiens se lo cultiva con escasez de N, se estimula la velocidad de producción y el número de nódulos en las raíces de esta planta. Las bacterias así cultivadas también resultan más competitivas para nodular respecto a aquellas cultivadas en suficiencia de N. En esta condición de escasez de N se dispararía la respuesta severa (RS), sugiriendo que las mejoras en los parámetros simbióticos evaluados se deben a la expresión de distintos genes dependientes del segundo mensajero (p)ppGpp. Esta hipótesis se apoya en que la mutante en el gen rsh, cuyo producto regula la síntesis del (p)ppGpp, B. diazoefficiens LP5065, nodula pero fija menos N2. Consiguientemente, nos planteamos estudiar la RS en B. diazoefficiens con el fin de correlacionar los resultados que se obtengan con la capacidad simbiótica de estos rizobios. Así decidimos evaluar la expresión diferencial de proteínas frente a la presencia/ausencia de (p)ppGpp mediante proteómica.Se obtuvieron proteínas enriquecidas en las fracciones de membrana y citoplasmáticas de las cepas B. diazoefficiens USDA 110, cepa salvaje, y LP5065; en dos condiciones: Tratada (T) con solución mineral libre de C y N (en la que se dispararía la RS en la cepa salvaje), y No tratada (NT). Las proteínas se analizaron por nanoHPLC acoplado a un espectrómetro de masa con tecnología Orbitrap. Los espectros obtenidos fueron analizados con el programa Proteome Discoverer y los datos obtenidos fueron procesados con el programa Perseus con un análisis estadístico de t de Student con un p-valor ≤ 0,05.En la cepa salvaje identificamos, teniendo en cuenta los resultados de ambas fracciones, 2562 y 2689 proteínas para la condición T y NT, respectivamente. El análisis comparativo entre la condición T y la NT muestra 8 proteínas sobreexpresadas y 10 con menos nivel de expresión. Respecto a la cepa mutante se hallaron 2541 en la condición T y 2531 en la NT, con 7 proteínas sobreexpresadas y 8 proteínas disminuidas en su expresión entre T y NT. Dentro de las proteínas que se detectaron en una condición y no en la otra, identificamos un 1,2% de las proteínas totales en la condición T y un 2,9% en la condición NT para la cepa USDA 110. Para la cepa LP5065 se encontró un 1,7% de las proteínas totales en la condición T y un 2,1% de las proteínas totales en la condición NT.El número de proteínas identificadas es acorde a la resolución de la metodología elegida. A su vez el porcentaje de proteínas que se expresan diferencialmente entre la condición T y NT mostrarían una diferencia en el estado metabólico de ambas cepas sometidas al tratamiento. Del análisis de las proteínas diferenciales entre ambas cepas y condiciones esperamos obtener un esquema de las proteínas que se encuentran regulados en este sistema por (p)ppGpp, y así poder construir un modelo del funcionamiento de la respuesta severa en B. diazoefficiens, y su relación con la simbiosis en soja.