IBBM   21076
INSTITUTO DE BIOTECNOLOGIA Y BIOLOGIA MOLECULAR
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Moviloma plasmídico de una bacteria del suelo: exploración del presente y recuerdos del pasado
Autor/es:
SALAS, M.E.; NILSSON, J. N.; DRAGHI W. O.; LAGARES, A.; LÓPEZ, J.L.; MOGRO, E.; CASTELLANI, L.; DEL PAPA, M.F.; LOZANO M. J.; ALBICORO, F.; TORRES TEJERIZO, G.A.; PISTORIO, M.
Lugar:
Mar del Plata
Reunión:
Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental; 2018
Institución organizadora:
Asociación Argentina de Microbiología
Resumen:
Los rizobios son alfa- y beta-proteobacterias con capacidad de formar nódulos fijadores de nitrógeno en asociación con raíces de plantas leguminosas. A pesar de esta característica común a los rizobios, los genomas de los mismos son altamente diversos atento a que constituyen un grupo muy heterogéneo de bacterias más allá de la genética conservada vinculada a sus genes simbióticos (ej. genes nod). Desde el punto de vista genómico-estructural muchos rizobios (aunque no todos) poseen genomas multipartitos constituidos por un cromosoma, por uno o más megaplásmidos (miles de kilobases) portadores de genes simbióticos, y por plásmidos (de tamaño medio-alto, decenas a centenas de kilobases) conocidos como plásmidos crípticos atendiendo a que las funciones asociadas a los mismos son mayormente desconocidas. El conjunto de genescontenido en plasmidos es conocido en términos genéricos como plasmidoma, o como moviloma plasmídico cuando se quiere hacer mención al carácter móvil-conjugativo de muchos representantes de este compartimento genético. Tomando como modelo al rizobio modelo Sinorhizobium meliloti, simbionte de Medicago, Melilotus y Trigonella que hemos estudiado en el laboratorio durante años, en este trabajo mostraremos un análisis compartivo del contenido informacional de cada uno de sus compartimentos genéticos (cromosoma, pSymA, pSymB, plasmidoma críptico). Mostraremos la heterogeneidad genética de cada uno de ellos a nivel de especie, y el grado relativo en que cada replicón incorpora nueva información por transferencia génica horizontal. Por otra parte mostraremos cómo el uso de herramientas filogenéticas acopladas al análisis del uso de codones por el rizobio pueden ser utilizadas para identificar grupos de genes de distinta ancestralidad utilizando al cromosoma como modelo de análisis. Mostraremos finalmente que el uso de codones en los grupos de genes más ancestrales es el mejor adaptado a la maquinaria traduccional del rizobio, y que dicha observación es un hecho frecuente también presente en otras bacterias no simbióticas gram-negativas y gram-positivas muy diferentes de los rizobios. Los resultados que hemos obtenido han permitido poner en evidencia la plasticidad relativa de cada uno de los compartimentos genómicos, su relación con el moviloma plasmídico, yel modo en que la preferencia en el uso de codones se modifica en tiempos evolutivos con un sesgo hacia aquel que es utilizado por los genes más altamente expresados.