CONICET | Buscador de Institutos y Recursos Humanos

Los baculovirus poseen un genoma de DNA doble cadena circular de 80 a 180 kb e infectan a invertebrados produciendo cuadros denominados poliedrosis nuclear y granulosis. Por su especificidad y virulencia, numerosos miembros de la familia Baculoviridae son utilizados como bioinsecticidas. Nuestro equipo de investigación caracterizó al baculovirus autóctono EpapGV y demostró su potencial para el control del lepidóptero plaga Epinotia aporema (barrenador de brotes). Recientemente, se obtuvo el primer borrador de la secuencia completa del genoma de EpapGV. Para ello, el DNA se aisló de cuerpos de oclusión purificados a partir de larvas de E. aporema infectadas y se envió al ICBR Genomics Core - 454 Sequencing Facility (University of Florida, Gainsville, USA). Como primer resultado se obtuvieron dos contigs que suman 119112 bp, quedando dos gaps por resolver. La orientación relativa de los dos bloques de secuencias se ensambló en base al mapa de restricción y los datos de secuencia nucleotídica parcial determinados previamente. En conjunto, la información sobre el tamaño del genoma, su mapa de restricción y el contenido de GC deducidos a partir de este borrador se acercan mucho a nuestras estimaciones previas. El análisis preliminar de marcos de lectura abiertos (ORFs) de un mínimo de 40 codones, en ambos contigs y en ambas polaridades, dio como resultado 398 ORFs. La comparación con los 42 genomas baculovirales secuenciados hasta ahora (10 de ellos corresponden a granulovirus) indicó la presencia de los 31 genes core, que se encuentran conservados en todos los baculovirus. Por otra parte, unos 70 ORFs definidos de acuerdo al esquema de búsqueda no exhiben homología con ninguno de los genes baculovirales conocidos y algunos podrían ser exclusivos de EpapGV. CONCLUSIÓN: Si bien existen puntos que necesitan ser resecuenciados, este primer borrador del genoma de EpapGV es congruente con datos previamente reportados por nuestro equipo. En particular, se encontraron aquellos genes denominados esenciales en los baculovirus y también genes exclusivos de granulovirus (género Betabaculovirus). La identidad potencial de los ORFs encontrados deberá complementarse con un análisis bioinformático más exhaustivo y con estudios transcripcionales in vivo.