Análisis transcripcional del gen SMc03140 de S. meliloti, un regulador transcripcional negativo del tipo GntR cuya mutación genera efectos negativos para la colonización de alfalfa, pero no de arveja

ANKE BECKER; EUGENIA SALAS; EZEQUIEL G. MOGRO; ANTONIO LAGARES; MAURICIO J. LOZANO; ANKE BECKER; EUGENIA SALAS; EZEQUIEL G. MOGRO; ANTONIO LAGARES; MAURICIO J. LOZANO

Mar del Plata

Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental; 2018

Asociación Argentina de Microbiología

Sinorhizobium meliloti es una α-proteobacteria capaz de establecer asociaciones simbioticas con plantas de los géneros Medicago, Melilotus y Trigonella. Esta asociación es el resultado de un complejo diálogo molecular entre los simbiontes, que se diferencian a lo largo de la interacción para dar lugar a un nódulo fijador de nitrógeno. El nicho simbiótico accesible a los rizobios está naturalmente limitado, y resulta ocupado por aquellas cepas que muestran ser más competitivas. La competitividad es un fenómeno complejo, en el que son particularmente relevantes los procesos que tienen lugar en la vida rizosférica temprana. En nuestro laboratorio hemos trabajado anteriormente en la búsqueda de determinantes genéticos de S. meliloti involucrados en etapas tempranas de colonización radicular a través del screening a gran escala de mutantes etiquetados (STM). Producto de este análisis y la posterior validación, hemos identificado que la mutación en el gen SMc03140, codificante de un factor de transcripción de la familia GntR, genera efectos negativos en la colonización de la rizosfera de plantas de la familia Trifoliae. Con el objetivo de identificar los genes regulados por esta proteína hemos realizado ensayos de transcriptómica diferencial de un mutante por inserción de mTn5 en el gen Smc03140 y la bacteria salvaje (sin mTn5) crecidos en medio mínimo Vincent con Manitol como fuente de carbono, utilizando microarreglos Sm6kOligo que permitieron analizar todas las regiones codificantes de S. meliloti (6208 genes). El análisis de los arreglos fue realizado utilizando la plataforma ArrayLims y Emma. Los resultados obtenidos indican que el producto del gen Smc03140 es capaz de auto-regular su propia transcripción (m-value -3,96, p-value 9,16E-08) y a su vez es capaz de regular el operón vecino (Smc03139, Smc03138) (m-value -6,02, -3,57; p-value 8,77E-08, 1,00E-07, respectivamente), posiblemente involucrado en la fosforilación de azúcares.