?Genome sequencing of the broad-host-range Rhizobium sp. LPU83 and characterization of its chromosomal phylogenetic relationships?

TORRES TEJERIZO, GONZALO; DEL PAPA, MARÍA FLORENCIA; LOZANO, MAURICIO JAVIER; GIUSTI, MARÍA DE LOS ÁNGELES; MARTINI, MARÍA CARLA; SALAS, MARÍA EUGENIA; SALTO, ILEANA PAULA; LAGARES, ANTONIO; PISTORIO, MARIANO

Tucumán

Congreso; ?VII Congreso Argentino de Microbiología General, SAMIGE Del Bicentenario?; 2011

SAMIGE

Secuenciación y caracterización de la cepa de amplio rango de huésped Rhizobium sp. LPU83 Gonzalo Torres Tejerizo, María Florencia Del Papa, Mauricio Lozano, María de los Ángeles Giusti1, Carla Martini, Eugenia Salas, Ileana Salto, Antonio Lagares, y Mariano Pistorio IBBM (Instituto de Biotecnología y Biología Molecular), CCT-CONICET-La Plata, Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina. Maximo: 3000 caracteres El cultivo de alfalfa ocupa en Argentina más de 6 millones de hectáreas destinadas esencialmente a la producción de forraje . La capacidad de alfalfa para asociarse con la bacteria fijadora de nitrógeno Ensifer meliloti permite el uso rotativo del cultivo en combinación con plantas productoras de grano, manteniendo el contenido de N del suelo en niveles aceptables a lo largo de los años. La paulatina acidificación de los suelos es una limitante de la asociación de alfalfa con E. meliloti. Además de la asociación de alfalfa con E. meliloti, esta leguminosa es capaz de asociaciarse con E. medicae y con un tipo menos caracterizado de rizobios denominados rizobios tipo Oregon . En nuestro laboratorio se han caracterizado en los últimos años los rizobios tipo Oregon, aislamientos ácido tolerantes capaces de nodular alfalfa, poroto, y Leucena leucocephala, altamente competitivos con E. meliloti en acidez e ineficientes en la fijación de Nitrógeno. Estas características posicionan a los rizobios tipo Oregon como un potencial factor de riesgo en los suelos de cultivo frente al simbionte eficiente de alfalfa. La cepa R. sp. LPU83 es representativa de los rizobios tipo Oregon y proviene de un suelo local. La cercana relación entre los genes simbióticos de E. meliloti y la cepa R. sp. LPU83 se encuentra apoyada por análisis de los genes nodC y nodH. Sin embargo, el análisis de secuencias del ADN cromosomal como 16S posiciona a los tipo Oregon cerca de R. etli. Con una estructura genética que conserva evidencias claras de eventos de transferencia horizontal de genes, los rizobios tipo Oregon representan un valioso sistema para entender mejor los mecanismos subyacentes de la diversificación de rizobios y evolución de rizobios. Surge así la inquietud de estudiar, de manera detallada, la genética de estas cepas, en la búsqueda de similitudes y diferencias con otros rizobios eficientes en la fijación de Nitrógeno, por estos motivos realizamos el secuenciamiento de la cepa LPU83. Martens et al. (2007, 2008) describieron un grupo de genes robustos para realizar aproximaciones filogenéticas (dnaK, glnA, gltA, gyrB, recA, rpoB, y thrC). De esta manera, utilizamos los mismos genes para estudiar la posición filogenética del replicón cromosomal y hemos podido observar que el cromosoma de Rhizobium sp. LPU83 se encuentra estrechamente relacionado con Agrobacterium radiobacter K84 y Rhizobium Gallicum R-4387. La secuencia completa de LPU83 será valiosa para ampliar el conocimiento de los fenotipos peculiar de esta cepa y las características taxonómicas de LPU83.