Análisis bioinformático de los sistemas regulatorios del rizobio ácido tolerante Rhizobium favelukesii

SARMIENTO, L; PISTORIO, M; NILSSON, J

Montevideo

Congreso; RELAR-PGPR-2021; 2021

Asociación Latinoamericana de Rizobiología

La alfalfa es una leguminosa forrajera de gran relevancia, y su asociación simbiótica con el rizobio eficiente, Ensifer (Sinorhizobium) meliloti, se veafectada en suelos ácidos principalmente debido a la baja tolerancia a la acidezpor parte de este rizobio. Hace algunos años se aisló un rizobio ácido-toleranterecientemente denominado Rizhobium Favelukesii, que es muy competitivo parala nodulación de alfalfa pero ineficiente en la fijación biológica de nitrógeno. Estascaracterísticas, más parasíticas que simbióticas, lo convierten en un potencial factor de riesgo en suelos agrícolas donde coexiste y compite con E. meliloti. Estudiostranscriptómicos demostraron que R. favelukesii comparte parte de la respuestaal estrés ácido con el rizobio ácido-sensible E. meliloti, sin embargo, los perfiles deexpresión de un gran número de genes no son coincidentes entre las respuestas deambos rizobios. Que la mayoría de los genes expresados diferencialmente esténpresentes en ambos genomas conduce a la hipótesis de que la diferencia entre unfenotipo ácido-sensible y uno ácido-tolerante puede recaer principalmente en lospatrones espacio-temporales de expresión de ambos rizobios frente al mismo estrés. En este contexto, en este trabajo se realizó un análisis bioinformático globalde los sistemas regulatorios de R. favelukesii, y en particular de aquellos posiblemente asociados al fenotipo ácido tolerante. Se identificaron y caracterizaron 666reguladores transcripcionales presentes en el genoma de R. favelukesii LPU83, queincluyen factores sigma, sistemas de dos componentes y sistemas de un componente. Su clasificación en familias mostró perfiles similares en cuanto a distribución y cantidades en relación a los previamente descriptos para rizobios relacionados. A su vez, a partir de un análisis predictivo de los sitios de unión a factores detranscripción, se encontraron varios motivos que surgen como potenciales sitiosde unión involucrados en la respuesta de R. favelukesii frente al estrés ácido.