IGEVET   21075
INSTITUTO DE GENETICA VETERINARIA "ING. FERNANDO NOEL DULOUT"
Unidad Ejecutora - UE
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- Análisis de fragmentos de ADN (microsatélites): Determinación de los genotipos de productos de amplificaciones de microsatélites.(ST 37)[+]Detalle STANDeterminar el tamaño de fragmentos de ADN de marcadores genéticos (microsatélites) utilizando un secuenciador automático.Prestación DetallePreparación de los productos de amplificaciones de microsatélites, la cuantificación de la muestra de ADN enviada, la realización de la corrida en un secuenciador de ADN y envío en formato electrónico de los datos de salida del secuenciadorMetodologíaPreparación de las diluciones de los productos de amplificaciones de microsatélites, preparación de la mezcla de corrida junto con un marcador de peso molecular (ET550-R size standard), corrida en un secuenciador de ADN de tecnología capilar y envío en formato electrónico de los datos de salida del secuenciador.Equipamientotermociclador Axigen MAXIGEN | microcentrífuga Eppendorf 5424 | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Clavemicrosatelites
fragmentos
- Identificación genética: Paternidad/maternidad en caninos: Determinación de la paternidad/maternidad de un/a perro/a o una muestra biológica mediante el análisis de marcadores genéticos (microsatélites).(ST 247)[+]Detalle STANPermite la confirmación o rechazo de la paternidad o maternidad discutida mediante la comparación del perfil genético de un canino con el de los supuestos progenitores, madre y padre (paternidad total) o con el de uno de los supuestos progenitores, madre o padre (paternidad parcial) o individuos problema con cédulas de identificación de los progenitores alegados.Prestación DetalleExtracción de ADN, cuantificación del ADN obtenido, amplificación por PCR de un set de marcadores de tipo microsatélite, preparación de los productos de amplificación, electroforesis en un secuenciador de ADN, lectura e interpretación de los datos crudos, determinación del perfil genético, preparación y envío del informe.MetodologíaA partir de la muestra se realiza la extracción de ADN mediante la utilización diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. El ADN es cuantificado utilizando un espectrofotómetro para micro-volúmenes y utilizado para amplificar por PCR marcadores genéticos (microsatélites). Posteriormente se realiza la dilución de los productos de amplificación, preparación de la mezcla de corrida junto con un marcador de peso molecular (ET550-R size standard), corrida en un secuenciador de ADN de tecnología capilar, determinación de los perfiles genéticos de cada muestra utilizando un software específico (Fragment Profiler 3.0, GE Health Care), determinación del perfil genético, comparación de los perfiles genéticos de los individuos involucrados, elaboración de un informe y envío del mismo en formato electrónico.Equipamientotermociclador Bio-Rad My cicler | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750 | fuente de poder Bio-Rad power pac 3000 | termociclador Axigen MAXIGEN | microcentrífuga Eppendorf 5424 | cámara fotográfica Kodak Easy share Z712 ISDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Clavepaternidad
caninos
maternidad
identificación
- Identificación genética: Determinación de la especie animal de origen en alimentos o muestras biológicas : Identificación de la especie animal de origen en alimentos o muestras biológicas por medio del análisis de ADN. (ST 251)[+]Detalle STANIdentificación de la/s especie/s animal/es a las que pertenecen las materias primas que componen un alimento, un alimento balanceado o cualquier otra muestra biológica (carne, sangre, orina, leche, quesos, pelos, huesos, etc.).Prestación DetalleExtracción de ADN utilizando diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. Cuantificación y amplificación por PCR de fragmentos específicos. La identificación de la especie se realiza por diferentes técnicas: secuenciación, amplificación por PCR con primers específicos de especie, RFLP, pirosecuenciación, etc.MetodologíaExtracción de ADN utilizando diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. El ADN es cuantificado mediante la utilización de un espectrofotómetro para micro-volúmenes y utilizado para amplificar por PCR fragmentos específicos. La identificación de la especie se realiza por diferentes técnicas: secuenciación (en un secuenciador de ADN de tecnología capilar), amplificación por PCR utilizando primers específicos de especie, RFLP (comparación de patrones obtenidos por digestión de un fragmento amplificado por PCR con enzimas de restricción), pirosecuenciación (utilizando un pirosecuenciador Quiagen PSQ 96MA), etc.Equipamientofuente de poder Bio-Rad power pac 3000 | pirosecuenciador de ADN QUIAGEN PSQ 96 MA | microcentrífuga Eppendorf 5424 | cámara fotográfica Kodak Easy share Z712 IS | termociclador Bio-Rad My cicler | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750 | termociclador Axigen MAXIGEN | centrífuga clínica ROLCO 3070Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialServicios veterinariosPalabras Claveidentificacion
alimentos
especie
- Identificación genética: Robo de ganado (abigeato): Determinación de los genotipos de productos de amplificación de microsatélites provenientes de muestras (referencia y evidencia) enviadas por dependencias del Poder Judicial(ST 246)[+]Detalle STANPermite la resolución de casos de robo de ganado mediante la comparación de los perfiles genéticos de evidencias judiciales con los perfiles de las muestras de referencia.Prestación DetallePreparación de los productos de amplificaciones de microsatélites, la cuantificación de la muestra de ADN enviada, la realización de la corrida en un secuenciador de ADN y envío en formato electrónico de los datos de salida del secuenciadorMetodologíaA partir de la muestra se realiza la extracción de ADN utilizando diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. El ADN es cuantificado mediante la utilización de un espectrofotómetro para micro-volúmenes y utilizado para amplificar por PCR marcadores genéticos (microsatélites). Posteriormente se realiza la dilución de los productos de amplificación, la preparación de la mezcla de corrida junto con un marcador de peso molecular (ET550-R size standard), la corrida en un secuenciador de ADN de tecnología capilar, la determinación de los perfiles genéticos de cada muestra utilizando un software específico (Fragment Profiler 3.0, GE Health Care), el análisis comparativo de los perfiles obtenidos, la interpretación de la información genética, la elaboración de un informe y el envío del mismo en formato electrónico.Equipamientoespectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750 | fuente de poder Bio-Rad power pac 3000 | termociclador Axigen MAXIGEN | microcentrífuga Eppendorf 5424 | cámara fotográfica Kodak Easy share Z712 IS | termociclador Bio-Rad My ciclerDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Claveabigeato
identificación
microsatélites
forense
- Identificación genética: Identificación Individual: Determinación del perfil genético de un animal o una muestra biológica mediante el análisis de marcadores genéticos (microsatélites).(ST 250)[+]Detalle STANTipificación y análisis de los genotipos de productos de amplificaciones de microsatélites con el fin de determinar el perfil genético de un animal o una muestra biológica.Prestación DetalleExtracción de ADN, cuantificación del ADN obtenido, amplificación por PCR de un set de marcadores de tipo microsatélite, preparación de los productos de amplificación, electroforesis en un secuenciador de ADN, lectura e interpretación de los datos crudos, determinación del perfil genético, preparación y envío del informe.MetodologíaA partir de la muestra se realiza la extracción de ADN mediante la utilización de diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. El ADN es cuantificado por un espectrofotómetro para micro-volúmenes y utilizado para amplificar por PCR marcadores genéticos (microsatélites). Posteriormente se realiza la dilución de los productos de amplificación, preparación de la mezcla de corrida junto con un marcador de peso molecular (ET550-R size standard), corrida en un secuenciador de ADN de tecnología capilar, determinación de los perfiles genéticos de cada muestra utilizando un software específico (Fragment Profiler 3.0, GE Health Care), determinación del perfil genético, elaboración de un informe y envío del mismo en formato electrónico.Equipamientomicrocentrífuga Eppendorf 5424 | cámara fotográfica Kodak Easy share Z712 IS | termociclador Bio-Rad My cicler | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750 | termociclador Axigen MAXIGEN | fuente de poder Bio-Rad power pac 3000Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Claveidentificación
individual
- Identificación genética: Asignación racial: Determinación del perfil genético que permita la asignación racial de una muestra biológica.(ST 245)[+]Detalle STANTipificación y análisis de los genotipos de productos de amplificación de marcadores genéticos (microsatélites) con el fin de determinar la raza de origen de un animal o una muestra biológica.Prestación DetalleExtracción de ADN, cuantificación del ADN obtenido, amplificación por PCR de un set de marcadores genéticos (microsatélites), preparación de los productos de amplificación, realización de la corrida en un secuenciador de ADN, lectura e interpretación de los datos crudos, análisis de los resultados mediante algoritmos de asignación racial, preparación y envío del informe.MetodologíaA partir de la muestra se realiza la extracción de ADN para ello se utiliza diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. El ADN es cuantificado con un espectrofotómetro para micro-volúmenes y utilizado para amplificar por PCR marcadores genéticos (microsatélites). Posteriormente se realiza la dilución de los productos de amplificación, preparación de la mezcla de corrida junto con un marcador de peso molecular (ET550-R size standard), corrida en un secuenciador de ADN de tecnología capilar, determinación de los perfiles genéticos de cada muestra utilizando un software específico (Fragment Profiler 3.0, GE Health Care), la obtención de los resultados mediante la utilización de algoritmos de asignación genética racial, la elaboración de un informe y el envío del mismo en formato electrónico.Equipamientofuente de poder Bio-Rad power pac 3000 | termociclador Axigen MAXIGEN | microcentrífuga Eppendorf 5424 | cámara fotográfica Kodak Easy share Z712 IS | termociclador Bio-Rad My cicler | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Claveidentificación
racial
- Identificación genética: Identificación Individual Canina: Determinación del perfil genético de un perro o una muestra biológica mediante el análisis de marcadores genéticos (microsatélites).(ST 249)[+]Detalle STANTipificación y análisis de los genotipos de productos de amplificaciones de microsatélites con el fin de determinar el perfil genético de un canino o una muestra biológica.Prestación DetalleExtracción de ADN, cuantificación del ADN obtenido, amplificación por PCR de un set de marcadores de tipo microsatélite, preparación de los productos de amplificación, electroforesis en un secuenciador de ADN, lectura e interpretación de los datos crudos, determinación del perfil genético, preparación y envío del informe.MetodologíaA partir de la muestra se realiza la extracción de ADN mediante la utilización de diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. El ADN es cuantificado por un espectrofotómetro para micro-volúmenes y utilizado para amplificar por PCR marcadores genéticos (microsatélites). Posteriormente se realiza la dilución de los productos de amplificación, preparación de la mezcla de corrida junto con un marcador de peso molecular (ET550-R size standard), corrida en un secuenciador de ADN de tecnología capilar, determinación de los perfiles genéticos de cada muestra utilizando un software específico (Fragment Profiler 3.0, GE Health Care), determinación del perfil genético, elaboración de un informe y envío del mismo en formato electrónico.Equipamientomicrocentrífuga Eppendorf 5424 | cámara fotográfica Kodak Easy share Z712 IS | termociclador Bio-Rad My cicler | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750 | termociclador Axigen MAXIGEN | fuente de poder Bio-Rad power pac 3000Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Claveidentificación
caninos
individual
paternidad
- Secuenciación de ADN(ST 244)[+]Detalle STANDeterminación de la secuencia de ADN a partir de fragmentos de PCR o de insertos en vectores de clonado. Cuantificación de la muestra de ADN enviada, la realización de una reacción de secuenciación, la purificación del producto obtenido, la corrida electroforética en un secuenciador de ADN y el envío de los datos de salida del secuenciador en formato electrónico.MetodologíaCuantificación y estimación de la calidad de la muestra de ADN enviada en un espectrofotómetro para micro-volúmenes, la realización de la reacción de secuenciación en un termociclador utilizando un kit de secuenciación, purificación del producto obtenido mediante precipitación diferencial, corrida en un secuenciador de ADN de tecnología capilar y envío de los datos de salida del secuenciador en formato electrónico.EquipamientoFuente de poder Bio-Rad POWER PAC 3000 | Termociclador Bio-Rad Mycicler | Sistema de documentación digital para geles Kodak DOC-6490 | Freezer Electrolux FE26 | Heladera con freezer Gafa Eurosystem Gafa Eurosystem | Microcentrífuga para placas Hermle Z326K | Fuente de poder Bio-Rad 1000/500 POWER SUPPLY | Termociclador Axigen Maxygen | Espectrofotómetro para microvolúmenes Thermo Fisher MultiskanGo | Secuenciador de ADN Applied Biosystem Hitachi/3500 Gene Analyzer | Termociclador Axigen Maxygen | Cámara fotográfica digital Kodak Easy share Z712 IS | Microcentrífuga para placas de PCR Labnet Internacional MPS 1000 | Microcentrífuga de tubos Eppendorf 5424Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIACampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialServicios veterinariosPalabras Clavesecuenciación
ADN
- Diagnóstico de genes de importancia económica/productiva: Determinación de genotipos de genes asociados a caracteres de importancia económica/productiva en animales domésticos.(ST 253)[+]Detalle STANDetección de variantes génicas asociadas a caracteres de importancia económico/productiva (por ejemplo: marmoreado, crecimiento, fertilidad, etc.)Prestación DetalleExtracción de ADN, cuantificación del ADN obtenido, amplificación por PCR de un set de marcadores de tipo SNP, preparación de los productos de amplificaciones, genotipificación de los productos de amplificación por RFLP en minigeles, pirosecuenciación o secuenciación de ADN en un secuenciador de ADN de tecnología capilar, lectura e interpretación de los datos crudos, análisis de los resultados, preparación y envío del informe.MetodologíaExtracción de ADN mediante la técnica apropiada según la muestra problema, cuantificación del ADN obtenido mediante la utilización de un espectrofotómetro, amplificación por PCR de SNP de genes asociados a caracteres de importancia económica/productiva. La identificación del genotipo se realiza por diferentes técnicas: secuenciación (en un secuenciador de ADN de tecnología capilar), amplificación por PCR utilizando primers específicos, RFLP (comparación de patrones obtenidos por digestión de un fragmento amplificado por PCR con enzimas de restricción), pirosecuenciación (utilizando un pirosecuenciador Quiagen PSQ 96MA), etc. Lectura e interpretación de los datos crudos, análisis de los resultados, preparación y envío del informe.Equipamientotermociclador Bio-Rad My cicler | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750 | termociclador Axigen MAXIGEN | fuente de poder Bio-Rad power pac 3000 | pirosecuenciador de ADN QUIAGEN PSQ 96 MA | microcentrífuga Eppendorf 5424 | cámara fotográfica Kodak Easy share Z712 ISDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Clavegenes
producción
diagnóstico
- Identificación genética: Paternidad/maternidad: Determinación de la paternidad/maternidad de un animal o una muestra biológica mediante el análisis de marcadores genéticos (microsatélites).(ST 248)[+]Detalle STANPermite la confirmación o rechazo de la paternidad o maternidad discutida mediante la comparación del perfil genético de un individuo con el de los supuestos progenitores, madre y padre (paternidad total) o con el de uno de los supuestos progenitores, madre o padre (paternidad parcial) o individuos problema con cédulas de identificación de los progenitores alegados.Prestación DetalleExtracción de ADN, cuantificación del ADN obtenido, amplificación por PCR de un set de marcadores de tipo microsatélite, preparación de los productos de amplificación, electroforesis en un secuenciador de ADN, lectura e interpretación de los datos crudos, determinación del perfil genético, preparación y envío del informe.MetodologíaA partir de la muestra se realiza la extracción de ADN mediante la utilización de diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. El ADN es cuantificado por un espectrofotómetro para micro-volúmenes y utilizado para amplificar por PCR marcadores genéticos (microsatélites). Posteriormente se realiza la dilución de los productos de amplificación, preparación de la mezcla de corrida junto con un marcador de peso molecular (ET550-R size standard), corrida en un secuenciador de ADN de tecnología capilar, determinación de los perfiles genéticos de cada muestra utilizando un software específico (Fragment Profiler 3.0, GE Health Care), determinación del perfil genético, comparación de los perfiles genéticos de los individuos involucrados, elaboración de un informe y envío del mismo en formato electrónico.Equipamientocámara fotográfica Kodak Easy share Z712 IS | termociclador Bio-Rad My cicler | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750 | termociclador Axigen MAXIGEN | fuente de poder Bio-Rad power pac 3000 | microcentrífuga Eppendorf 5424Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Clavepaternidad
maternidad
identificación
- Diagnóstico de enfermedades de origen genético: Determinación de ciertas enfermedades de origen genético en animales domésticos.(ST 252)[+]Detalle STANAnálisis de los genotipos de genes asociados a enfermedades de origen genético en un animal doméstico.Prestación DetalleExtracción de ADN, cuantificación del ADN obtenido, amplificación por PCR de marcadores específicos para cada patología, preparación de los productos de amplificaciones, genotipificación de los productos de amplificación por diferentes técnicas: secuenciación, amplificación por PCR con primers específicos, RFLP, pirosecuenciación, etc., análisis de los resultados, preparación y envío del informe.MetodologíaExtracción de ADN utilizando diferentes métodos de acuerdo a la naturaleza del material de partida. El ADN es cuantificado mediante la utilización de un espectrofotómetro para micro-volúmenes y utilizado para amplificar por PCR fragmentos específicos. La identificación del genotipo se realiza por diferentes técnicas: secuenciación (en un secuenciador de ADN de tecnología capilar), amplificación por PCR utilizando primers específicos, RFLP (comparación de patrones obtenidos por digestión de un fragmento amplificado por PCR con enzimas de restricción), pirosecuenciación (utilizando un pirosecuenciador Quiagen PSQ 96MA), etc. Lectura e interpretación de los datos crudos, análisis de los resultados, preparación y envío del informe.Equipamientotermociclador Axigen MAXIGEN | fuente de poder Bio-Rad power pac 3000 | pirosecuenciador de ADN QUIAGEN PSQ 96 MA | microcentrífuga Eppendorf 5424 | cámara fotográfica Kodak Easy share Z712 IS | termociclador Bio-Rad My cicler | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | secuenciador de ADN General Electric MEGA BASE 750Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras Claveenfermedades
genéticas
diagnóstico
- Asesoramiento en radiobiología para "Curso de residentes en radioterapia"(ST 703)[+]Detalle STANTareas de capacitación en el ámbito de la oncología radioterápica dirigidas a la comprensión de fenómenos y efectos radiobiológicos pertinentes a tratamientos radiantes.MetodologíaCurso de dictado mensualDisciplina PrimariaCiencias MédicasDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónProm.Gral.del Conoc.-Cs.MedicasActividad IndustrialFormación de posgradoPalabras ClaveRadiobiología
Radioterapia
Genética
Radiaciones
Oncología
- Servicio de genética toxicológica(ST 715)[+]Detalle STANEvaluación genotóxica de posibles contaminantes ambientales, fármacos de uso corriente, aditivos alimenticios u otros productos de potencial toxicidad, mediante pruebas específicas de análisis citogenético y citomolecular. Evaluación de nuevos fármacos como parte de estudios previos a su lanzamiento al mercado.MetodologíaCultivo de células in vitro. Ensayos disponibles: Ensayo de micronúcleos en células binucleadas, Ensayo de electroforesis en células aisladas (Ensayo Cometa), Analisis de aberraciones cromosómicas estructurales (ACE).EquipamientoCabina de bioseguridad Esco AC2-651Disciplina PrimariaBiologíaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónSanidad ambientalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras ClaveGENOTOXICIDAD
ALTERACIONES CROMOSOMICAS
MICRONUCLEOS
ENSAYO COMETA
- Servicio de citogenética de los animales domésticos(ST 714)[+]Detalle STANCaracterización cromosómica de especies y detección de anomalías numéricas y estructurales. Determinación del número cromosómico de las muestras con el fin de establecer la subespecie de los animales de origen o la posible ocurrencia de anormalidades. Determinación de ploidía. Cariotipado.MetodologíaCultivo de linfocitos de sangre periférica. Análisis de imágenes en microscopio óptico. Conteo de cromosomas en placas metafásicas.EquipamientoCabina de bioseguridad Esco AC2-651Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras ClaveCITOGENETICA
ALTERACIONES CROMOSOMICAS
- Servicio de análisis bioinformático de microarreglos de transcriptomas. Nivel básico(ST 994)[+]Detalle STANContempla el preprocesamiento, análisis estadístico y minería de datos de matrices de perfiles de expresión génica generados por cualquiera de las plataformas comerciales de microarreglos de oligonucleótidos de uno o dos colores.MetodologíaSe dispone de un servidor dedicado con BioLinux-6 workstation y un cliente FTP para que el usuario del servicio deposite su información garantizado la confidencialidad de la información. Para el pre-procesamiento de datos se emplean los métodos más robustos tales como RMA y fRMA mediante análisis con R-Bioconductor. En análisis estadístico de los datos se realiza con el programa open-source MultiExperiment Viewer (4.8), el cual dispone de una amplia gama de algoritmos de clasificación y comparación para la identificación de 'gene expressio signatures'. Se genera una lista de genes diferencialmente expresados donde se detallan la identidad de cada gene (Probe_ID, Gene_ID, Entrez_ID, RefSeq, Descripción del gen, etc), la significancia estadística (p-value, p-value ajustado), correcciones por FDR (q-value), y la intencidad del cambio (Fold Changes). Para el data mining se emplean múltiples recursos informáticos tales como: Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) y REViGO, KEGG, etc. con la finalidad de identificar términos de Ontología Génica de significancia estadística y relevancia funcional.EquipamientoServidor de alta performance y alta capacidad de almacenamiento, bajo costo, de Hewlett Packard ProLiant DL180 G6 Server 2U | Servidor de alta performance, bajo costo, de procesador dual para entornos de Co Hewlett Packard ProLiant DL160 G6 Server 2UDisciplina PrimariaInformática y ComunicacionesDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónOtros camposActividad IndustrialActividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.Palabras ClaveBIOINFORMÁTICA
MICROARRAY
TRANSCRIPTOMA
- Diagnósticos de SNPs por Pirosecuenciación.: Servicio Completo. Procesamiento de las muestras y determinación de los genotipos de los productos de amplificación biotinilados por pirosecuenciación.(ST 1260)[+]Detalle STANDeterminar la secuencia de ADN contigua a la mutación de interés mediante la técnica de pirosecuenciaciónPrestación DetalleDiseño del método de pirosecuenciación. Extracción y amplificación del ADN. Purificación de los productos de amplificación biotinilados mediante la utilización de perlas de sefarosa. Realización de la corrida de pirosecuenciación e interpretación de los resultados. Envío de los resultados en formato electrónico.MetodologíaDiseño del método de pirosecuenciación. Extracción del ADN. Amplificación del segmento de ADN biotinilado por PCR. Preparación de las soluciones de lavado, desnaturalización, binding y annealing para purificar los productos de amplificación mediante la work-station. Preparación del mix de secuenciación y corrida en el pirosecuenciador. Análisis de los resultados mediante el software PYROMARK Q96MA. Envío de los resultados en formato digital.Equipamientomicrocentrífuga Eppendorf 5424 | freezer Electrolux FE 26 | Servidor de alta performance, bajo costo, de procesador dual para entornos de Co Hewlett Packard ProLiant DL160 G6 Server 2U | Agitador de placa Labnet Internacional Orbit P4 | termociclador Bio-Rad My cicler | termociclador Axigen MAXIGEN | microcentrífuga Eppendorf 5415 | termociclador Axigen MAXIGEN | termociclador Bio-Rad DNA Engine | pirosecuenciador de ADN QUIAGEN PSQ 96 MA | Vacum Prep Stand Biotage 60-0208 00013RBDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónVarios camposActividad IndustrialCría de animalesPalabras ClaveSNPs
Pirosecuenciación
Genotipificación
- Diagnósticos de SNPs por Pirosecuenciación.: Servicio Básico. Determinación de los genotipos de los productos de amplificación biotinilados por pirosecuenciación.(ST 1259)[+]Detalle STANDeterminar la secuencia de ADN contigua a la mutación de interés mediante la técnica de pirosecuenciaciónPrestación DetallePurificación de los productos de amplificación biotinilados mediante la utilización de perlas de sefarosa. Realización de la corrida de pirosecuenciación e interpretación de los resultados. Envío de los resultados en formato electrónico.MetodologíaPreparación de las soluciones de lavado, desnaturalización, binding y annealing para purificar los productos de amplificación mediante la work-station. Preparación del mix de secuenciación y corrida en el pirosecuenciador. Análisis de los resultados mediante el software PYROMARK Q96MA. Envío de los resultados en formato digital.Equipamientofreezer Electrolux FE 26 | Servidor de alta performance, bajo costo, de procesador dual para entornos de Co Hewlett Packard ProLiant DL160 G6 Server 2U | Agitador de placa Labnet Internacional Orbit P4 | termociclador Bio-Rad My cicler | termociclador Axigen MAXIGEN | microcentrífuga Eppendorf 5415 | termociclador Axigen MAXIGEN | termociclador Bio-Rad DNA Engine | pirosecuenciador de ADN QUIAGEN PSQ 96 MA | Vacum Prep Stand Biotage 60-0208 00013RB | microcentrífuga Eppendorf 5424Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónVarios camposActividad IndustrialCría de animalesPalabras ClaveSNPs
Pirosecuenciación
Genotipificación
- Evaluación de Premios SENASA(ST 1406)[+]Detalle STANEvaluación de los trabajos presentados para los Premios SENASA a la investigación.Disciplina PrimariaBiologíaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialServicios veterinariosPalabras Claveproducción
sanidad
genética
- Análisis de microarrays de mediana densidad(ST 2127)[+]Detalle STANAnálisis de muestras de ADN mediante microarrays de SNPs de mediana densidad (1-50K).MetodologíaLas muestras de ADN son sometidas inicialmente a una amplificación genómica seguida de una fragmentación mediante la incubación con una DNAasa. El producto fragmentado es verificado en una corrida electroforética. Posteriormente, se lleva a cabo la reacción de hibridación entre las sondas fijadas al arrays y la muestra de ADN. Finalmente, se realizan los lavado y los procesos de tinción y amplificación para que el arreglo pueda ser escaneado por la plataforma. Los datos crudos son procesados por el software Genotyping Console (Affymetrix).EquipamientoPlataforma de microarrays para tecnología Axiom Affymetrix Geme TitanDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialCría de animalesPalabras Clavemicroarrays
SNPS
selección genómica
asociación genómica
- Corrección y revisión integral de textos. Traducción(ST 2267)[+]Detalle STAN1. Revisión integral de contenido. 2. Corrección de estilo (ortografía, gramática y sintaxis). 3. Corrección de pruebas de galera.MetodologíaLectura y análisis crítico de los contenidos sujetos a corrección, revisión y/o traducción.Disciplina PrimariaLiteratura, Lingüistica y SemióticaDisciplina DesagregadaLINGUISTICA-OTRASCampo de AplicaciónPromocion general del conocimientoActividad IndustrialServicios de traducción e interpretaciónPalabras Clavecorrección y revisión
traducción
- Microarrays de expresión génica de transcriptoma(ST 2333)[+]Detalle STANEl STAN consiste en el análisis de muestras de ADNc mediante microarrays de análisis de transcriptoma de tecnología Axion en una plataforma Gen Titan y el posterior procesamiento de los datos crudos.MetodologíaLa cantidad y calidad del ADNc recibido es medida mediante espectrofotometría y electroforesis en geles de agaroas. Posteriormente, el ADNc es preprocesado. Una vez verificado el ADNc procesado es hibridado con las sondas fijadas al soporte del microarrays, y después de sucesivos lavados, el producto de hibridación es detectado mediante anticuerpos y escaneado por la plataforma Gene Titan. La imagen capturada es procesada y las muestras y genes son filtrados de acuerdo a diferentes parámetros utilizando la consola de Affymetrix. Finalmente, los datos procesados son exportados n diferentes formatos y enviados al solicitante de la prestación.EquipamientoCentrifuga de mesa para centrifugar tubos Ependorf a 17000G Eppendorf 5415 R | Microcentrífuga Labnet Internacional 24D Digital | Horno de hibridación 1 Affymetrix Gene Chip Hybridization Oven 645 | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | freezer Electrolux FE 26 | Horno de hibridación 2 Affymetrix Gene Chip Hybridization Oven 645 | Heladera de Laboratorio Sigma FV-131 | Servidor de alta performance, bajo costo, de procesador dual para entornos de Co Hewlett Packard ProLiant DL160 G6 Server 2U | Agitador de placa Labnet Internacional Orbit P4 | Plataforma de microarrays para tecnología Axiom Affymetrix Geme TitanDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialServicios de apoyo agrícolas y pecuariosPalabras Clavemicroarrays
SNPS
selección genómica
asociación genómica
biobancos
- Microarrays de SNPs de media y alta densidad(ST 2334)[+]Detalle STANEl STAN consiste en el análisis de muestras de ADN genómico mediante microarrays de SNPs de mediana y alta densidad de tecnología Axion en una plataforma Gen Titan y el posterior procesamiento de los datos crudos.MetodologíaLa cantidad y calidad del ADN genómico recibido es medida mediante espectrofotometría y electroforesis en geles de agaroas. Posteriormente, el ADN es fragmentado mediante DNAasas y amplificado a nivel genómico mediante PCR isotérmico. Una vez verificado el producto de amplificación genómica es hibridado con las sondas fijadas al soporte del microarrays, y después de sucesivos lavados, el producto de hibridación es detectado mediante anticuerpos y escaneado por la plataforma Ge Titan. La imagen capturada es procesada y las muestras y SNPs son filtrados de acuerdo a diferentes parámetros (QC, dQC, call rate) utilizando el software Axiom Analysis Suite. Finalmente, los datos procesados son exportados n diferentes formatos (txt, tped, ped) y enviados al solicitante de la prestación.EquipamientoHorno de hibridación 1 Affymetrix Gene Chip Hybridization Oven 645 | espectrofotómetro para microvolúmenes General Electric Nano Vue | freezer Electrolux FE 26 | Horno de hibridación 2 Affymetrix Gene Chip Hybridization Oven 645 | Heladera de Laboratorio Sigma FV-131 | Servidor de alta performance, bajo costo, de procesador dual para entornos de Co Hewlett Packard ProLiant DL160 G6 Server 2U | Agitador de placa Labnet Internacional Orbit P4 | Plataforma de microarrays para tecnología Axiom Affymetrix Geme Titan | Centrifuga de mesa para centrifugar tubos Ependorf a 17000G Eppendorf 5415 R | Microcentrífuga Labnet Internacional 24D DigitalDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-GENETICA (BIOGENETICA)Campo de AplicaciónProduccion animalActividad IndustrialServicios de apoyo agrícolas y pecuariosPalabras Clavemicroarrays
SNPS
selección genómica
asociación genómica
biobancos
- Asesoría en Análisis Genealógicos en Equinos(ST 2731)[+]Detalle STANAsesoría en análisis de datos genéticos y genómicos para interpretación de genealogías y/o aplicación en genealogías equinas.MetodologíaInterpretación de datos genéticos y genómicos a partir de resultados de tipificación por ADN de marcadores moleculares equinos (autosómicos, sexuales y mitocondriales) dirigidos al uso de la información para planificar cruzamientos y planes de cría, seleccionar progenitores, identificar portadores de patologías y analizar genealogías en razas puras y registros genealógicos públicos o privados. Lectura, interpretación y análisis de datos genéticos y genómicos para el análisis e interpretación de genealogías equinas. Proponer criterios para interpretación de resultados obtenidos en el análisis de ADN. Asesoría para elaborar propuestas destinadas a fijar los criterios de aceptación o rechazo de progenitores. Asesorar en el mantenimiento del recurso zoogenético, ofrecer valor a sus progenitores y cumplir con los objetivos de los planes de selección estratégicos.Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaVETERINARIA Y ESP. PECUARIASCampo de AplicaciónSanidad animalActividad IndustrialCría de ganado equino realizada en haras (Incluye la producción de semen) | Cría de ganado equino, excepto la realizada en haras (Incluye equinos de trabajo, asnos, mulas, burdéganos)Palabras ClaveAsesoramiento
Genealogías
equino
linajes
- Biotecnología de la reproducción bovina: Capacitación y asesoramiento en biotecnología de la reproducción bovina (ST 3650)[+]Detalle STANCapacitaciones presenciales o a distancia. Asesoramiento para la resolución de inconvenientes en laboratorios de Biotecnología de la Reproducción en BovinosMetodologíaReuniones presenciales o virtuales. Se realizarán capacitaciones según la demanda del contratante referentes a Biotecnología de la Reproducción Bovina: producción in vitro de embriones, confección de medios de cultivo, congelamiento de embriones, superovulación, transferencia embrionaria, inseminación a tiempo fijo, diagnóstico de gestación por ecografía, apta reproductiva, aspiración folicular guiada por ecografía.Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaCIENCIAS AGROPECUARIAS Y VETERINARIASCampo de AplicaciónProduccion animal-BovinaActividad IndustrialCría de animalesPalabras ClaveBIOTECNOLOGÍA
REPRODUCCIÓN ASISTIDA
EMBRIONES BOVINOS
LABORATORIO FIV
IATF
- Pruebas in vitro de toxicidad reproductiva: Pruebas de toxicidad in vitro en maduración de ovocitos (MIV), fertilización in vitro (FIV) y desarrollo in vitro de embriones bovinos (CIV).(ST 3651)[+]Detalle STANEvaluación de la toxicidad de productos alimentarios, químicos, farmacéuticos, cosméticos o cualquier compuesto de potencial toxicidad para la reproducción humana y/o veterinaria durante las etapas de maduración, fertilización y desarrollo preimplantacional in vitro en el modelo bovino.MetodologíaLos ovocitos bovinos se recuperarán de ovarios de frigorífico de hembras jóvenes sometidas a previa inspección sanitaria (SENASA). Los ovocitos inmaduros serán madurados y fertilizados con semen bovino. Los cigotos se cultivarán in vitro hasta la fase de blastocisto. Los ovocitos / embriones serán expuestos a los productos químicos a testear en cada uno de los siguientes pasos: maduración, fertilización y desarrollo temprano del embrión. Los ensayos toxicológicos ofrecidos son: metafase II para MIV, formación de pronúcleos para FIV y desarrollo del blastocisto hasta su eclosión para CIV. Adicionalmente, se realizará una prueba de proliferación celular basada en el efecto del compuesto a testear en el metabolismo celular (Ensayo de MTT) de líneas celulares de origen no reproductivo que permite evaluar efectos tóxicos inespecíficos. Este test se usa en asociación con los test mencionados previamente para diferenciar el efecto tóxico general del efecto tóxico específico sobre los procesos reproductivos.EquipamientoLector de Elisa Fisher Biotec ELX800 | Balanza analítica Mettler Toledo ME 204 | Termo Criogénico MVE Lab Series Millenium 200 - XC 20 | Centrifuga Rolco 2070 | Flujo Laminar Esco Class II Bsc | Baño termostático Vicking Masson 1002 | Microscopio Fluorescencia Olympus BX 40 F4 | Lupa Estereoscópica Nikon SMZ 800 | Estufa de cultivo NuAire UN - 4750E CassouDisciplina PrimariaBiologíaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónOtros camposActividad IndustrialCría de animalesPalabras ClaveTOXICOLOGIA REPRODUCTIVA
PRODUCCIÓN DE EMBRIONES IN VITRO
- Ensayo in vitro de desarrollo embrionario bovino preimplantacional (ST 5763)[+]Detalle STANEl servicio consiste en el análisis de la capacidad de desarrollo embrionario posterior de ovocitos bovinos con fines científicos y de desarrollo tecnológico. El STAN permite evaluar el efecto de diversos factores (como, por ejemplo, tratamientos sobre la hembra donante, medios de cultivo, etc.) sobre la capacidad de desarrollo del ovocito hasta el estadio de blastocisto.MetodologíaLos ovocitos provistos por terceros se madurarán y fertilizarán in vitro. Los presuntos cigotos se cultivarán in vitro durante 7 días hasta el estadio de blastocisto. El laboratorio donde se lleva adelante el STAN se encuentra registrado y habilitado conforme la normativa vigente del SENASA. Se le entregará al contratante un informe resumiendo los resultados del ensayo y de requerirse, los embriones producidos.EquipamientoEstufa de cultivo Thermo Scientific 4111 TS | Flujo Laminar vertical Esco ESCO CLASS II | Termo Criogénico MVE Lab Series Millenium 200 - XC 20 | Termo Criogénico 47 lts MVE Lab Series XC 47-11 | Heladera con freezer Gafa 468022 | Baño termostático Vicking MassonDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaCIENCIAS AGROPECUARIAS Y VETERINARIASCampo de AplicaciónProduccion animal-BovinaActividad IndustrialCría de animalesPalabras ClavePIV
REPRODUCCION ASISTIDA
- Control genético de cepas consanguíneas de ratones - INBRED STRAINS(ST 5762)[+]Detalle STANDeterminación del perfil genético de las muestras de ratones analizadas y comparación con los estándares de las cepas correspondientes con el fin de confirmar su identidad y detectar posibles adulteraciones.MetodologíaEl presente servicio incluye, la extracción del ADN de las muestras de cola u oreja mediante la técnica de extracción orgánica. Una vez obtenido el ADN se verificará la calidad y cantidad en geles de agarosa y por espectrofotometría. La tipificación de ADN se llevará a cabo mediante la amplificación por medio de PCR de un panel de microsatélites y los alelos serán analizados en geles de agarosa. Finalmente se enviarán los resultados en formato digital.EquipamientoMicrocentrífuga de tubos Eppendorf 5424 | Fuente de poder Bio-Rad POWER PAC 3000 | Microcentrífuga Eppendorf 5415C | Horno de Hibridación Affymetrix Appligene GeneChip 645 | Termociclador Axigen Maxygen | freezer Electrolux FE 26 | Espectrofotómetro para microvolúmenes Thermo Fisher MultiskanGo | Servidor de alta performance, bajo costo, de procesador dual para entornos de Co Hewlett Packard ProLiant DL160 G6 Server 2U | Agitador de placas orbital Labnet Internacional Orbit S2020-P4-B | Termociclador Axigen Maxygen | Cámara fotográfica digital Kodak Easy share Z712 ISDisciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaBIOLOGIA-OTRASCampo de AplicaciónVarios camposActividad IndustrialInvestigación y desarrollo experimental en el campo de las ciencias exactas y naturales n.c.p.Palabras ClaveMicrosatélites
Control Genético
Genotipificación
Ratones de laboratorio
- Capacitación a integrantes de la cadena productiva láctea bovina. Aspectos a tener en cuenta desde la obtención de leche de calidad hasta la elaboración de productos lácteos.(ST 6164)[+]Detalle STANEl objetivo de la capacitación es que los participantes adquieran los conocimientos y herramientas necesarias en relación al proceso de obtención, manipulación, saneamiento y procesamiento de la leche cruda bovina de calidad. Elaboración de quesos.MetodologíaMódulo 1: 5 horas Presentación. El sector lechero en el mundo. Legislación. Principios del Codex Alimentarius. Buenas Prácticas Ganaderas y Buenas Prácticas de Manufactura. Procedimientos Operativos Estandarizados de Sanitización. Control de proveedores. Mantenimiento programado de equipos. El Sistema HACCP. Módulo 2: 5 horas Calidad y trazabilidad de la leche cruda. Estructura general de la leche. Propiedades. Componentes principales: carbohidratos, sales, lípidos, proteínas, enzimas, microorganismos deseables e indeseables. Parámetros indicativos de la calidad de la leche. Control de calidad de la leche. Medidas preventivas para evitar los residuos en la leche. Legislación sobre residuos de medicamentos. Módulo 3: 5 horas Ordeño. Conservación de la leche cruda en el tambo, almacenamiento. Transporte. Recepción de la leche cruda en la industria. Estandarización. Módulo 4: 5 horas Pasteurización y esterilización de la leche. Métodos de conservación de la leche en la industria láctea. Clasificación. Elaboración de quesos: principios de la elaboración del queso. Etapas fundamentales del proceso. Maduración y características del queso. Proteólisis. Lipolisis. Desarrollo del flavor. Rendimiento quesero. Importancia económica y tecnológica de los subproductos lácteos (suero de queso, permeado de suero. Composición). Manejo de efluentes. Módulo 5: 5 horas Actividad Práctica: Elaboración de quesos. Metodología de la capacitación teórica: presencial o virtual (modalidad E-learning). Elaboración de quesos (opcional). Con Evaluación. Se entregara constancia de participación y aprobación de cada módulo.Disciplina PrimariaVeterinariaDisciplina DesagregadaVETERINARIA Y ESP. PECUARIAS-OTRASCampo de AplicaciónProm.Gral.del Conoc.-Cs.Agropec.y Veter.Actividad IndustrialElaboración de leches y productos lácteos deshidratados (Incluye la obtención de quesos, helados, manteca, postres lácteos, yogur y otros productos lácteos fermentados o coagulados cuando son obtenidos en forma integrada con la producción de leche)Palabras Claveproducción de leche bovina
industrialización de leche cruda bovina
capacitación a actores cadena láctea
calidad de alimentos lácteos