Diversidad Genética y Filogenia de las secuencias Argentinas del Virus de Arteritis equina

METZ GERMÁN ERNESTO; MARTIN OCAMPOS G; SERENA MARÍA SOLEDAD; DIAZ SILVINA; KALEMKERIAN PAULA; NOSETTO EDGARDO OMAR; ECHEVERRÍA MARÍA

Buenos Aires

Congreso; IX Congreso Argentino de Virología; 2008

Sociedad Argentina de Virología, Asociación Argentina de Microbiología

El objetivo de nuestro trabajo fue incrementar el conocimiento sobre la variabilidad genética, intentar establecer el origen de las cepas argentinas mediante el planteo de hipótesis filogenéticas entre las secuencias de VAE circulantes y analizar los mecanismos evolutivos que operan sobre el sector del ORF 5, identificado como mas variable del VAE. Se utilizaron 5 cepas virales argentinas y 8 muestras de semen de archivo. Se realizo RT-PCR con primers especificos para el ORF 5 y luego se secuenció con primers internos. Se obtuvieron 3  muestras positivas de los 8 muestras de semen analizadas, y sus secuencias fueron registradas en el GenBank. El análisis filogenético se realizo con 76 secuencias de VAE de distintas regiones geográficas aplicando los algoritmos de neighbor-joining, máxima parsimonia y maximum likelihood, Tests de Tajima y de Nei-Gojobori. El análisis realizado muestra que este sector  posee un grado moderado de variabilidad en la secuencia. Se identificaron los grupos formados por las secuencias LP02, LT, RO, KB y RZ, que desde una óptica cladística constituyen un grupo monofilético con un ancestro común, mientras que la cepa LP01 esta separada de las restantes. Podemos inferir que las cepas argentinas tienen un origen polifilético, probablemente debido al continuo tránsito de equinos y que esta región posee información filogenética para resolver relaciones históricas entre secuencias donde la principal fuerza de cambio que opera es la fijación de mutaciones puntuales que permiten el surgimiento de nuevas cepas.