GENOTIPIFICACIÓN Y ANÁLISIS DE MUESTRAS BOVINAS MEDIANTE LA TECNOLOGÍA AXIOM® DE MICROARRAYS DE HD EN ARGENTINA

GIOVAMBATTISTA G.; LIRON J.P.; ROGBERG MUNOZ A.; FORNERIS NS.; POSIK DM.; VILLEGAS CASTAGNASSO EE; MORALES HF.; OLIVERA LH.; CANTET R.J.C; PERAL GARCIA P.

Bariloche

Congreso; XLIII Congreso Argentino de Genética y IV Reunión Regional SAG La Pampa-Patagonia; 2014

Sociedad Argentina de Genética

Durante los últimos años, la tecnología de microarrays de SNPs ha sido ampliamente utilizada en bovinos para estudiar la diversidad genética de las poblaciones, las relaciones entre las razas, la evolución del genoma de esta especie (desequilibrio de ligamiento, selección, etc.), la determinación del grado de parentesco genómico entre individuos, el origen de muestras e individuos (asignación racial), así como, para mapear regiones/genes asociadas a caracteres cuali y cuantitativos. Además, esta tecnología ya está siendo aplicada rutinariamente en los procesos de mejora genética en muchas razas bovinas. Durante el presente año se ha instalado en el IGEVET una plataforma GeneTitan® (Affymetrix, CA, USA), iniciándose los estudios de tipificación de muestras de ADN pertenecientes a las principales razas bovinas criadas en el país mediante el array de alta densidad de SNPs Affymetrix Axiom Genome-Wide BOS 1 Array (648.874 SNP). En la presente disertación se presentan y discuten los resultados obtenidos hasta el momento, los que permitieron las estimaciones del call rate por muestra y por SNP, los valores promedios y la distribución de locus polimórficos, los valores de MAF y heterocigosidad, el equilibrio de Hardy-Weinberg, y el tamaño promedio y distribución de los bloques de ligamiento. Los resultados obtenidos son comparados y discutidos con aquellos estimados a partir del uso de los arrays Illumina High-Density Bovine BeadChip Array (777.962 SNPs) y BovineSNP50 v2 DNA Analysis BeadChip (54.609 SNPs).