IMBECU   20882
INSTITUTO DE MEDICINA Y BIOLOGIA EXPERIMENTAL DE CUYO
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Variación en el número de copias (CNV) como factor pronóstico de pacientes con cáncer de mama, teniendo en cuenta amplificaciones y deleciones que involucran genes HSPs
Autor/es:
GUERRERO GIMENEZ, MARTIN EDUARDO; ZOPPINO FELIPE CARLOS MARTIN; FERNANDEZ-MUÑOZ, JUAN MANUEL
Lugar:
Mendoza
Reunión:
Jornada; XXVI Jornada de Investigación de la Secretaria de Investigación, Internacionales y Posgrado de la Universidad Nacional de Cuyo.; 2020
Institución organizadora:
Secretaria de Investigación, Internacionales y Posgrado de la Universidad Nacional de Cuyo.
Resumen:
Las proteínas del golpe de calor (HSP), además de tener un rol protagónico en el mantenimiento de la homeostasis celular, se ha demostrado que cumplen un papel muy importante en el desarrollo y la evolución de distintos tipos de tumores. En el cáncer de mama (CM) muchos de los miembros de esta familia varían sus niveles de expresión génica, aumentando o disminuyendo la cantidad de ARNm, y estas variaciones en algunos casos, repercuten en la sobrevida de los pacientes. El cáncer es una enfermedad genética, donde se afecta la función de genes críticos reguladores del crecimiento y la sobrevida de las células. Dentro de estas alteraciones se encuentran la variación en el número de copias (CNV). Las CNV son segmentos de ADN, mayores a 1k base y menores a 5M bases, que presentan un número de copias distinto comparado a un genoma de referencia. Estudios llevados a cabo por nuestro grupo de investigación, han identificado múltiples HSP con aumento en el número de copias (amplificaciones), así como también, otras con disminuciones (deleciones). El objetivo del este trabajo es evaluar la significancia clínica de las CNV en los genes HSP, con el fin de identificar si estas alteraciones estructurales a nivel del ADN repercuten en la sobrevida de los pacientes con CM. Para lograr dicho objetivo se utilizó el lenguaje de programación R. Los datos para analizar las CNV fueron descargados de la base de datos pública ?The Cancer Genome Atlas? (TCGA), y se utilizó el paquete de Bioconductor ?CNTools? para identificar las HSP con amplificaciones y deleciones. Por último, el efecto de las CNV halladas sobre la sobrevida de los pacientes se estimó utilizando el modelo de riesgo proporcional de Cox univariado, junto a la información de supervivencia de los pacientes del TCGA. Se graficaron las curvas de Kaplan-Meier y se comparó la distribución de supervivencia mediante la prueba Log-Rank Resultados: múltiples HSP presentaron tanto amplificaciones como deleciones, algunas de éstas fueron en subtipos específicos de CM, mientras que otras fueron compartidas en todos los pacientes. Llamativamente, tres miembros del subgrupo de las chaperoninas: TCP1, CCT2 y CCT8 presentaron amplificaciones con altos coeficientes de correlación con los niveles de ARNm y la sobrevida de los pacientes. Estos hallazgos proveen información útil para comprender el perfil de CNV de los genes HSP y facilitar la búsqueda de nuevos marcadores pronósticos y blancos terapéuticos.