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El daño mecánico y la herbivoría generan respuestas fisiológico-moleculares tanto en los tejidos afectados directamente como en órganos sanos distantes al sitio dañado. Así, hemos descripto que las heridas en cotiledones de girasol inhiben el crecimiento foliar y reducen su consumo por herbivoría. Para conocer las respuestas moleculares a distancia analizamos el perfil de expresión génica de hojas de plántulas sanas o dañadas en sus cotiledones usando microarreglos de aproximadamente 40.000 unigenes de Helianthus annuus ordenados en una plataforma Agilent. Los RNAs aislados 5 hs después del daño se procesaron e hibridaron en el Centro de Investigaciones Príncipe Felipe (Valencia). Comparando las medias de tratados y controles se identificaron 336 genes expresados diferencialmente (DEGs) con valor p ≤ 0.01 que se validaron posteriormente por análisis de componentes principales. Los DEGs se agruparon usando Blast2GO en base a sus ontologías (GOs) y a los códigos enzimáticos (EC) asociados a las secuencias. Entre las GOs modificadas resultaron de especial interés las de los siguientes componentes celulares: mitocondrias, sistema de endomembranas y complejos de factores de transcripción. Entre los procesos biológicos afectados encontramos los relacionados con respuesta a estrés y a estímulos químicos, fosforilación de proteínas, regulación de la transcripción y biogénesis-organización de pared celular. En consistencia con estos resultados las funciones moleculares afectadas fueron la unión a DNA y ATP y las actividades de oxidoreductasas, proteína-quinasas y ATPasas así como ECs responsables de la biosíntesis de fenilpropanoides, flavonoides, alcaloides y glutatión. Las implicancias de la regulación de la transcripción y de los metabolitos secundarios en las respuestas de defensa frente a herbívoros serán discutidas.