CIFASIS   20631
CENTRO INTERNACIONAL FRANCO ARGENTINO DE CIENCIAS DE LA INFORMACION Y DE SISTEMAS
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
TRABAJO COLABORATIVO ENTRE BIÓLOGOS E INFORMÁTICOS PARA EL DISEÑO E IMPLEMENTACIÓN DE LA BASE DE DATOS SUNFLOWER
Autor/es:
L. ANGELONE, P. FERNÁNDEZ, A. PONS, C. REYNARES, P. BULACIO, N. PANIEGO, E. TAPIA
Lugar:
Rosario
Reunión:
Jornada; IV Jornada de Ciencia y Tecnologia UNR; 2010
Institución organizadora:
UNR
Resumen:
A través de un convenio de colaboración entre el INTA Castelar y el CIFASIS- FCEIA-UNR se diseñó e implementó la base de datos SfGD (Sunflower Genomic Database)1. Esta base fue diseñada para almacenar, gestionar y consultar información genómica de ESTs del girasol cultivado (Helianthus annuus L.)2 enmarcado en un proyecto del INTA Castelar3. Se implementó una BD relacional utilizando el paquete LAMP4,5. Actualmente, la base se encuentra alojada en el servidor del INTA y se está realizando el proceso de carga de los datos biológicos resultantes de la investigación. El siguiente paso es aplicar la SfGD para extraer información útil para el proyecto genómico. El objetivo principal del diseño fue lograr una estructura de base de datos simple con una interfaz web que permita consultar la base en un lenguaje accesible a usuarios no especialistas en informática, sabiendo que esta herramienta será, en un futuro cercano, un recurso de acceso público para la comunidad científico/académica interesada en consultar información molecular asociada a esta especie de interés agronómico. Desde el punto vista informático, construir una base de datos es simple, sin embargo el informático debió interiorizarse, con ayuda de los biólogos, de la estructura de los datos biológicos y de su dinámica, lo cual afectó el tiempo de desarrollo. Desde el biológico, el diseño conjunto permitió generar un lenguaje en común, clarificando y ordenando la información para la determinación de tablas, campos y tipos de datos necesarios. Desde el punto de vista del trabajo colaborativo, esta interacción dio lugar a la identificación de intereses comunes y la planificación de acciones conjuntas con las que abordar, de manera multidisciplinaria, proyectos de investigación, cursos de capacitación y la consolidación de un área de vacancia como lo es la Bioinformática en nuestro país.